当合同甲方与发票付款方不一致时，通常需要开具“三方付款说明”或“委托付款证明”来证明这种不一致的合理性及合法性。以下是对此问题的详细分析：
开具“三方付款说明”：
- 适用场景：当合同甲方、发票开具方（通常是乙方或服务提供方）以及实际付款方为三个不同的主体时，为了证明实际付款方是受合同甲方的委托或同意进行付款的，可以开具三方付款说明。
- 内容要点：三方付款说明应明确载明合同甲方的名称、发票开具方的名称、实际付款方的名称，以及三方之间的委托付款关系或同意付款的声明。同时，应说明这种付款方式不会影响合同各方的权利和义务，并由三方签字或盖章确认。
开具“委托付款证明”：
- 适用场景：如果合同甲方明确委托第三方（即实际付款方）代为支付合同款项，那么可以开具委托付款证明。
- 内容要点：委托付款证明应明确载明委托方（合同甲方）的名称、受托方（实际付款方）的名称、委托付款的具体事项（如支付合同款项）、委托付款的金额以及委托付款的期限等。同时，应说明受托方在委托范围内的付款行为视为委托方的付款行为，并由委托方和受托方签字或盖章确认。
额外建议：
- 确保合同条款明确：在签订合同时，如果预计可能会出现合同甲方与发票付款方不一致的情况，建议在合同中明确约定这种付款方式，并说明各方对此的认可和同意。
- 保留相关证据：除了开具上述证明外，还应保留与付款相关的所有证据，如银行转账记录、付款通知书等，以备不时之需。
- 咨询专业意见：如果对此类证明的具体开具方式或内容有疑问，建议咨询具有相关经验的律师或财务人员，以确保证明的合法性和有效性。
在实际操作中，开具哪种证明取决于具体的业务场景和合同条款。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。