没有合同关系的单位之间签署的施工管理协议，其法律效力需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、协议内容合法且双方真实意思表示

1. 法律效力：如果施工管理协议的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且是双方真实意思的表示，那么该协议通常具有法律效力。这意味着，即使双方原本没有直接的合同关系，但通过签署施工管理协议，双方建立了新的法律关系，并应受该协议的约束。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。

二、协议内容违法或存在欺诈、胁迫等情形

1. 法律效力：如果施工管理协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，导致一方在违背真实意思的情况下签署了协议，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。
2. 法律后果：一旦协议被认定为无效或可撤销，双方之间的法律关系将恢复到签署协议前的状态，且可能面临法律责任的追究。例如，因欺诈、胁迫等情形签署的协议，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销，并有权要求对方承担赔偿责任。

三、协议主体资格问题

1. 法律效力：如果签署施工管理协议的双方中，有一方或双方不具备相应的民事行为能力（如未取得相应的施工资质、未依法登记注册等），那么该协议可能因主体资格问题而无效。
2. 法律建议：在签署施工管理协议前，双方应仔细审查对方的主体资格，确保对方具备签署和履行协议的能力。同时，也可以考虑在协议中约定相应的违约责任和争议解决方式，以降低法律风险。

四、实际履行情况对协议效力的影响

1. 法律效力：即使施工管理协议在签署时存在某些瑕疵或不确定性，但如果双方在实际履行过程中已经按照协议的内容进行了操作，且没有提出异议或采取其他法律措施，那么该协议可能因实际履行而被视为有效。
2. 法律实践：在实际法律实践中，法院或仲裁机构在判断协议效力时，往往会考虑双方的实际履行情况。如果双方已经按照协议的内容进行了实质性的履行，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么法院或仲裁机构可能会倾向于认定该协议有效。

总结与建议：

• 在没有合同关系的单位之间签署施工管理协议时，应确保协议内容合法、双方真实意思表示，并仔细审查对方的主体资格。
• 如果协议签署后存在争议或不确定性，建议及时咨询专业律师，以便采取适当的法律措施来维护自己的合法权益。
• 在实际履行过程中，双方应严格按照协议的内容进行操作，并保留好相关证据，以备不时之需。

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