结论：员工因不胜任工作而离职，老板一般不能随意扣工资，但具体是否扣工资以及扣工资的情况需根据实际情况和法律规定来判断。
分析说明：
员工不胜任工作与离职的关系：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，如果员工确实不能胜任工作，用人单位应当对其进行培训或者调整工作岗位。如果经过培训或调整岗位后，员工仍然不能胜任工作，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。但这一过程中，并不直接涉及扣工资的问题。
扣工资的合法性：
- 工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得随意扣除。除非存在法定或约定的扣款情形，如劳动者违反用人单位规章制度、造成用人单位经济损失等，且扣款金额需符合法律规定（如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准）。
- 在员工因不胜任工作而离职的情况下，如果用人单位没有合法依据（如员工违反规章制度、造成经济损失等），则不得随意扣工资。
特殊情况下的工资处理：
- 如果员工在离职前存在未完成的工作任务或给用人单位造成了经济损失，用人单位可以依据法律规定和劳动合同约定，要求员工承担相应的赔偿责任。但这种赔偿应当通过合法途径进行，如协商、仲裁或诉讼，而不是直接扣工资。
- 如果员工与用人单位在劳动合同中有关于不胜任工作离职时工资处理的特别约定，且该约定不违反法律强制性规定，那么双方应当按照约定执行。
法律建议：
- 对于员工：如果因不胜任工作而离职，且担心工资被扣，可以首先与用人单位进行沟通协商，明确离职时的工资结算方式。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于用人单位：在处理员工不胜任工作离职的问题时，应当严格遵守法律规定和劳动合同约定，不得随意扣工资。如果确实需要员工承担赔偿责任，应当通过合法途径进行，并确保扣款金额和方式符合法律规定。
可能后果：
- 如果用人单位随意扣工资，可能面临劳动监察部门的处罚和劳动者的法律诉讼，不仅需要支付被扣的工资，还可能需要支付赔偿金和承担诉讼费用等额外成本。
- 对于员工来说，如果工资被非法扣除，可以通过法律途径维护自己的权益，但可能需要花费一定的时间和精力。
行动建议：
- 如果你或你所在的用人单位面临类似问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。