当面临工程款结算纠纷，且合同中已明确约定争议解决方式为诉讼时，您可以按照以下详细且严谨的步骤来操作，以维护自身合法权益：
一、明确合同内容与纠纷焦点
详细审查合同：首先，您需要仔细审查建设工程施工合同及其补充协议，重点关注工程价款、结算方式、付款时间等核心条款。这些条款是确定双方权利义务的基础，也是后续诉讼中主张权益的关键依据。
确定纠纷焦点：明确纠纷的具体焦点，比如是工程款支付不足、结算方式存在争议，还是其他与结算相关的违约行为。这有助于您制定针对性的诉讼策略，提高诉讼效率。
二、诉讼前准备
收集证据：
- 合同文件：包括建设工程施工合同及其补充协议，以证明双方的权利义务关系。
- 工程资料：如施工图纸、工程变更通知、施工日志、验收报告等，这些资料能够证明施工过程及质量，是支持您主张的重要证据。
- 结算资料：结算书、送审报告、审计报告等，这些资料直接关联到工程款的结算，是主张工程价款的直接依据。
- 付款凭证：银行转账记录、支票存根等，以确认已付款金额，避免重复主张或遗漏。
- 往来函件：沟通信件、邮件等，可能包含对结算事项的重要认可或协商过程，有助于证明双方的真实意思表示。
确定诉讼主体：
- 原告：通常为施工方，即您或您所在的公司。
- 被告：建设单位（发包人），如果涉及共同发包、转包、违法分包等情况，需列明相关责任主体。
确定管辖法院：
- 根据《民事诉讼法》及相关司法解释，建设工程施工合同纠纷由不动产所在地人民法院管辖。因此，您需要明确工程所在地，并向该地有管辖权的法院提起诉讼。如果合同中有约定管辖法院，则按约定执行。
三、立案
起草起诉状：
- 起诉状应详细列明原被告信息、诉讼请求（如支付工程款的具体金额、利息及诉讼费用）、事实与理由，以及证据清单及来源。确保起诉状内容清晰、准确，能够充分表达您的诉求和理由。
提交立案材料：
- 将起诉状及证据材料提交至有管辖权的法院立案庭。法院将对材料进行审查，符合立案条件的将受理并向原告送达受理通知书，同时要求缴纳诉讼费用。
四、审理阶段
送达与答辩：
- 法院将起诉状副本、应诉通知书等法律文书送达给被告，告知其诉讼权利和义务。被告需在规定时间内提出答辩状，针对原告的诉讼请求进行回应和反驳。
证据交换与庭前准备：
- 开庭审理前，法院可能组织双方进行证据交换，让双方了解对方证据并初步审查。您需要准备庭审陈述及质证意见，确保在庭审中能够充分表达自己的观点并反驳对方。
开庭审理：
- 法庭调查：双方当事人陈述案件事实并举证、质证，法官查明案件基本事实。
- 法庭辩论：双方就案件事实、法律适用等问题进行辩论，阐述观点并反驳对方。这是庭审中的关键环节，您需要充分准备，确保辩论有力、有据。
- 最后陈述：双方当事人进行最后陈述，概括诉讼请求和观点。
调解：
- 在庭审过程中或庭审结束后，法院可能组织调解。如果双方能够自愿达成调解协议，且协议内容合法有效，那么调解协议将具有法律效力，双方需按照协议履行义务。
五、判决与执行
判决：
- 法院根据审理查明的事实和相关法律规定作出判决。如果判决支持您的诉讼请求，那么被告需履行判决义务；如果判决驳回您的诉讼请求或部分驳回，那么您需要考虑是否上诉或采取其他法律措施。
执行：
- 如果被告未履行判决确定的支付义务，您可向法院申请强制执行。法院将采取查询、冻结、划拨银行存款或查封、扣押、拍卖财产等措施以实现您的权益。
上诉：
- 如果您对一审判决不服，可在规定时间内向上级法院提起上诉。上诉过程中，您需要提交上诉状及相关证据材料，并缴纳上诉费用。上级法院将对案件进行二审审理，并作出终审判决。
六、专业支持与沟通协商
- 寻求专业律师帮助：在整个诉讼过程中，建议您寻求专业律师的帮助。律师能够为您提供专业的法律意见和诉讼策略，确保您的权益得到最大程度的保护。
- 沟通协商：在诉讼过程中或诉讼前，您也可以尝试通过和解或调解解决纠纷。这有助于节省时间和成本，避免诉讼带来的不确定性和风险。
综上所述，处理工程款结算纠纷需要严谨细致地遵循法律程序。从明确合同内容与纠纷焦点开始，经过充分的诉前准备、正式立案、审理阶段，直至判决与执行，每一步都需依法进行。希望以上解答能够对您有所帮助。