结论：国有养殖建设用地使用权合同到期后，政府未批复文件而直接发出收回决定书，其有效性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：
一、合同到期后的法律后果
合同自然终止：
- 国有养殖建设用地使用权合同通常会有明确的期限约定。合同到期后，如果没有续期或新的约定，合同自然终止。此时，土地使用权人应当按照合同约定或法律规定，将土地交还给出让方（通常是政府或相关部门）。
续期申请与批复：
- 如果土地使用权人希望继续使用土地，应当在合同到期前向出让方提出续期申请。出让方会根据土地利用规划、政策等因素，决定是否批准续期。如果出让方未在合理期限内给予批复，土地使用权人不能直接视为续期成功，但也不能直接视为土地被收回。
二、政府收回决定书的合法性
法定程序：
- 政府在收回国有土地使用权时，应当遵循法定程序。这通常包括发出收回通知、听取土地使用权人的陈述和申辩、进行听证（如果必要）等步骤。如果政府未按照法定程序进行，其收回决定书可能因程序违法而无效。
批复文件的重要性：
- 批复文件是政府对土地使用权人续期申请或土地收回申请的正式回应。如果政府未发出批复文件而直接发出收回决定书，这可能引发关于程序合法性的争议。然而，如果合同中明确规定了合同到期后土地自动收回，且无需政府另行批复，那么政府在合同到期后直接发出收回决定书可能是合法的。
具体情况具体分析：
- 国有养殖建设用地使用权合同的具体条款、土地利用规划、政策变化等因素都会影响政府收回决定书的合法性。因此，在判断政府收回决定书是否有效时，需要综合考虑这些因素。
三、法律建议
审查合同条款：
- 土地使用权人应首先审查合同条款，特别是关于合同到期后土地处理方式的约定。如果合同中有明确约定，应按照约定执行。
与政府沟通：
- 如果土地使用权人对政府的收回决定书有异议，应及时与政府沟通，了解收回的具体原因和依据。同时，可以要求政府提供相关的批复文件或法律依据。
寻求法律救济：
- 如果土地使用权人认为政府的收回决定书违法或侵犯了其合法权益，可以依法寻求法律救济。这包括提起行政复议或行政诉讼等途径。
进一步思考：在处理此类问题时，土地使用权人应充分了解自己的权利和义务，以及政府的职责和权限。同时，应密切关注土地利用规划和政策的变化，以便及时调整自己的经营策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。