结论概述：

1. 行李架自行拆除未备案，可能影响行驶证的合法性，具体取决于当地交通管理部门的规定。
2. 自行拆除行李架属于非法改装，若未进行备案或审批，将面临相应的法律处罚。
3. 非法改装可能影响商业险的理赔，具体取决于保险合同的条款和保险公司的政策。

详细分析：

1. 行李架自行拆除未备案对行驶证合法性的影响：

   • 行驶证是车辆合法上路的凭证，其上的信息应与车辆实际状况相符。若车辆原配有行李架，而车主自行拆除且未进行备案，这可能导致行驶证上的信息与车辆实际状况不一致。
   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，车辆改装或变更重要部件后，应向交通管理部门进行备案或审批。未进行备案或审批的，可能面临罚款、扣留车辆等处罚，并可能影响行驶证的合法性。
   • 具体影响取决于当地交通管理部门的规定和执法力度。有些地区可能对此类行为较为宽容，而有些地区则可能严格执法。

2. 自行拆除行李架是否属于非法改装：

   • 非法改装通常指的是未经交通管理部门批准，擅自改变车辆的结构、构造或特征。自行拆除行李架，尤其是原厂配备的行李架，属于改变车辆构造的行为。
   • 根据相关法律法规，任何对车辆结构的改变都应经过交通管理部门的批准或备案。未进行批准或备案的，即构成非法改装。
   • 非法改装不仅可能面临法律处罚，还可能影响车辆的年检、保险理赔等。

3. 非法改装对商业险理赔的影响：

   • 商业险的理赔通常基于保险合同的条款和保险公司的政策。保险合同中往往明确规定了保险范围、免责条款等。
   • 若保险合同中明确规定了非法改装导致的损失不予理赔，那么车主在自行拆除行李架后发生事故，可能面临保险公司拒赔的风险。
   • 即使保险合同中未明确提及非法改装，保险公司也可能根据内部政策或行业惯例，对非法改装导致的损失进行拒赔或部分拒赔。
   • 因此，车主在改装车辆前，应仔细阅读保险合同条款，并咨询保险公司的意见，以避免因非法改装而影响保险理赔。

建议与行动指南：

• 若您已自行拆除了行李架，建议尽快向当地交通管理部门进行备案或咨询相关政策，以确保行驶证的合法性。
• 在进行任何车辆改装前，务必了解并遵守相关法律法规和保险合同条款，以避免不必要的法律风险和经济损失。
• 若您对保险理赔有疑问或担忧，建议直接咨询您的保险公司或向我咨询，以获取更具体的指导和建议。