您好，关于车顶行李箱拆除是否需要备案的问题，这主要取决于您所在地区的具体交通管理规定以及车辆原始登记情况。但根据普遍的《机动车登记规定》（公安部令第164号），我可以给您一个相对明确的解答。

首先，如果车顶行李箱是车辆出厂时原装的，或者是已经经过合法备案后加装的，那么在拆除时，理论上也是需要进行备案的。因为拆除行李箱改变了车辆的外观和结构，按照《机动车登记规定》，这种变更需要在信息或事项变更后三十日内，向登记地车辆管理所申请变更备案。

具体的备案流程通常包括：

1. 将车辆开到车辆管理所或指定的车驾管社会服务站。
2. 查验并采集车辆照片。
3. 提供机动车所有人的身份证、行驶证原件等相关材料。

另外，值得注意的是：

• 在加装或拆除车顶行李箱时，都需要确保不改变车身的主体结构，并且要保证车辆的安全。
• 行李架的高度、长度等尺寸也需要符合《机动车运行安全技术条件》（GB7258-2017）的规定，例如行李架高度应小于或等于300mm，长度不应超过车长的三分之一。

最后，由于各地的交通管理规定可能存在差异，我建议您在拆除车顶行李箱前，最好先咨询当地的车辆管理所或交警部门，了解具体的备案要求和流程。这样可以确保您的操作符合当地的规定，避免不必要的麻烦和处罚。