抵销双方都超过诉讼时效的债务，通知是有效的，但能否实际抵销需视具体情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、诉讼时效与抵销的基本概念
诉讼时效，是指权利人在一定期间内不行使权利，即在某种程度上丧失请求利益的时效制度。在我国，一般的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
抵销，是指当事人双方互负债务，各以其债权充抵债务的履行，双方各自的债权和对应债务在对等额内消灭。抵销分为法定抵销和约定抵销。法定抵销是指依照法律规定，当符合一定条件时，任何一方当事人均可以自己的债务与对方的债务抵销。约定抵销则是指当事人双方协商一致，将自己的债务与对方的债务抵销。
二、超过诉讼时效的债务能否抵销
从法律原则上看：
- 超过诉讼时效的债务，虽然债权人的胜诉权消灭，但债权本身并不消灭。也就是说，债权人仍然有权向债务人主张债权，只是如果债务人提出诉讼时效抗辩，债权人将无法通过司法程序强制债务人履行。
- 抵销作为一种消灭债务的方式，其本质是双方互负债务的相互冲抵。因此，只要双方债务存在且符合抵销的条件（如种类、品质相同，到期且非专属等），理论上就可以进行抵销。
从实际操作上看：
- 如果双方均未提出诉讼时效抗辩：在这种情况下，双方可以基于债务的存在和抵销的合法性进行协商，并达成抵销协议。一旦协议达成，双方债务即在对等额内消灭。
- 如果一方提出诉讼时效抗辩：此时，虽然抵销通知本身是有效的（因为通知只是表达抵销的意愿，并不直接涉及诉讼时效问题），但能否实际抵销则取决于另一方的态度。如果另一方同意抵销，那么双方债务仍然可以在对等额内消灭；如果另一方不同意抵销，并坚持诉讼时效抗辩，那么抵销将无法实现。因为超过诉讼时效的债务，债权人无法通过司法程序强制债务人履行，也就无法强制债务人接受抵销。
三、法律建议
- 在抵销前明确债务状态：在尝试抵销之前，双方应明确各自的债务是否已超过诉讼时效。如果已超过，应评估对方是否可能提出诉讼时效抗辩。
- 协商达成抵销协议：为了避免纠纷和不确定性，建议双方通过协商达成抵销协议。在协议中明确抵销的债务范围、金额、方式等关键条款。
- 保留相关证据：无论是否达成抵销协议，双方都应保留与债务和抵销相关的所有证据（如借条、转账记录、抵销通知等）。这些证据在后续可能出现的纠纷中将起到关键作用。
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