结论：在工程未启动且保证金不退返的情况下，损失的认定需根据具体情况，结合合同条款、双方过错程度以及实际损失情况等多方面因素进行综合判断。以下是从不同角度对损失认定的详细分析：
一、合同条款的约定
保证金性质与退还条件：
- 首先，需要审查合同中关于保证金的性质、用途以及退还条件的约定。如果合同明确规定了保证金在特定条件下（如工程未启动）应予以退还，而对方拒绝退还，则对方可能构成违约。
- 若合同未明确约定保证金退还条件，或约定模糊，则需根据《民法典》中关于合同解释的原则，结合双方交易习惯、合同目的等因素进行合理推断。
违约责任条款：
- 合同中若约定了违约责任，包括违约金、损失赔偿等，当一方违约时，应按照合同约定承担相应的违约责任。
- 如果合同未约定违约责任或约定不明确，受损方有权要求违约方赔偿因违约造成的实际损失。
二、双方过错程度
过错责任原则：
- 在损失认定中，需考虑双方的过错程度。如果因一方过错导致工程未启动且保证金不退还，该方应承担相应的赔偿责任。
- 若双方均有过错，则应根据过错比例分担损失。
举证责任：
- 受损方需承担举证责任，证明对方存在过错以及自身因对方过错所遭受的实际损失。
- 举证内容可能包括合同文本、沟通记录、付款凭证、损失计算依据等。
三、实际损失情况
直接损失：
- 直接损失是指因对方违约行为直接导致的财产减少或支出增加，如已支付的保证金、为准备工程而产生的费用等。
- 直接损失通常较易计算，但需确保损失与违约行为之间存在直接因果关系。
间接损失：
- 间接损失是指因对方违约行为而导致的可得利益损失，如预期利润、业务机会等。
- 间接损失的计算可能较为复杂，需考虑多种因素，如市场情况、合同履行情况等。在司法实践中，间接损失的赔偿通常受到一定限制，需以合理预见为原则。
损失计算方法：
- 损失计算应基于实际损失情况，采用合理、科学的方法进行。对于直接损失，可根据实际支出或减少的财产价值进行计算；对于间接损失，可采用差额法、类比法等方法进行估算。
- 计算公式示例（以直接损失中的保证金为例）：若保证金为X元，且因对方违约导致无法退还，则直接损失为X元。若还存在其他直接损失，如准备工程费用Y元，则总直接损失为X+Y元。间接损失则需根据具体情况进行估算。
四、法律建议
协商解决：
- 在损失认定过程中，建议双方首先尝试通过协商解决争议。协商可以节省时间和成本，且有助于维护双方关系。
诉讼或仲裁：
- 若协商无果，受损方可以考虑通过诉讼或仲裁途径解决争议。在提起诉讼或仲裁前，应充分准备证据材料，明确诉讼请求或仲裁请求。
寻求专业法律帮助：
- 由于损失认定涉及复杂的法律问题和事实判断，建议受损方在必要时寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼或仲裁等服务，帮助受损方维护合法权益。
在处理此类纠纷时，请务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。