施工合同违反法律规定时，造价咨询单位应采取以下处理措施：

1. 立即停止相关咨询服务并审查合同
   造价咨询单位在发现施工合同存在违反法律规定的情形时，应立即暂停正在进行的造价咨询工作，避免因继续提供服务而扩大法律风险。同时，需对合同文本进行全面审查，重点核查合同条款是否违反《民法典》《建筑法》《招标投标法》等强制性规定，例如是否存在未依法招标、肢解发包、转包或违法分包等情形。若合同因违反效力性强制性规定而无效，造价咨询单位需重新评估服务基础是否合法。

2. 评估已完成的咨询成果效力
   若造价咨询单位已出具部分咨询成果（如预算编制、结算审核报告），需根据合同效力及成果用途进行风险评估：

   • 若合同无效但咨询成果被用于实际施工或结算，可能因“以合法形式掩盖非法目的”导致成果被否定，咨询单位需及时书面提示委托方风险，并留存沟通记录；
     
   • 若咨询成果尚未被使用，应主动撤回或修正，避免被认定为“协助违法”而承担连带责任。

3. 向委托方发出书面风险提示
   造价咨询单位应以书面形式向建设单位、施工单位等合同主体明确提示合同违法性，包括具体违法条款、法律后果（如合同无效、行政处罚、工程款纠纷等），并建议委托方采取补救措施（如重新招标、签订补充协议等）。若委托方坚持继续履行违法合同，咨询单位应拒绝继续服务并留存证据，避免被牵连进后续纠纷。

4. 配合行政监管或司法程序
   若行政主管部门介入调查或法院受理相关案件，造价咨询单位需如实提供咨询过程中的文件资料（如合同复印件、工作记录、沟通邮件等），并配合调查取证。若咨询单位被列为第三人或证人，应委托专业律师协助准备陈述材料，避免因表述不当承担法律责任。

5. 完善内部合规机制
   造价咨询单位应以此为契机，完善内部审核流程：

   • 在承接业务前增加合同合法性审查环节，要求委托方提供合同备案证明或招标文件等辅助材料；
     
   • 对高风险项目（如政府投资项目、EPC总承包项目）建立法律顾问复核制度；
     
   • 定期组织员工培训，强化对《建筑法》《招标投标法》等法规中效力性强制性规定的识别能力。

特殊情形处理：

• 若造价咨询单位因合同违法被牵连进诉讼，可主张“善意第三人”抗辩，但需证明自身已尽到形式审查义务（如核对合同主体资质、审查招标程序等）；
  
• 若咨询单位明知合同违法仍提供服务，可能面临行政处罚（如罚款、停业整顿）或民事赔偿（如与委托方承担连带责任），此时需立即终止合作并委托律师介入危机处理。

造价咨询单位在处理此类问题时，需平衡商业利益与法律风险，建议遇到复杂情形时直接向我咨询具体应对方案。