工程造价咨询单位违法，将由县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门或者有关专业部门给予相应的行政处罚，具体根据违法行为的性质、情节和后果确定。以下是针对不同违法行为的处理方式的详细分析：

一. 违法行为的种类及处理方式

1. 跨省、自治区、直辖市承接业务不备案：

   • 处理：由县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门或者有关专业部门给予警告，责令限期改正；逾期未改正的，可处以5000元以上2万元以下的罚款。

2. 涂改、倒卖、出租、出借资质证书，或者以其他形式非法转让资质证书：

   • 分析：此类行为严重违反了工程造价咨询行业的管理规定，破坏了市场秩序。
   • 处理：依据相关法规，此类违法行为将受到严厉的行政处罚，包括但不限于罚款、吊销资质证书等。

3. 以给予回扣、恶意压低收费等方式进行不正当竞争：

   • 分析：此类行为损害了行业公平竞争的环境，影响了其他咨询单位的合法权益。
   • 处理：监督检查机关将依法对此类行为进行查处，责令改正并可能处以罚款，同时记入信用档案，影响单位的市场信誉。

4. 其他法律、法规禁止的行为：

   • 处理：对于其他违反法律、法规的行为，将依据相关法律法规的规定进行处理，可能包括罚款、吊销资质、追究刑事责任等。

二. 监督检查与法律责任

• 监督检查：监督检查机关有权对工程造价咨询单位进行监督检查，纠正违反法律、法规和执业规程的行为，并将处理结果向社会公布。
• 法律责任：资质许可机关及其工作人员在履行职责过程中，如存在违法行为，将依法承担法律责任，包括行政处分和刑事责任。

我建议：工程造价咨询单位应严格遵守相关法律法规和执业规程，确保业务活动的合法性和规范性。如有违法行为，应及时纠正并接受相关部门的处理。同时，也建议咨询单位加强内部管理，提高员工的法律意识和职业素养，以防范和减少违法行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。