结论前置：在一般情况下，员工年假休完后辞职，用人单位不得扣回已休年假工资或要求返还年假天数。这是由相关法律法规明确保障的劳动者权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动法》
- 第四十五条规定：“国家实行带薪年休假制度。劳动者连续工作一年以上的，享受带薪年休假。”这意味着，只要劳动者符合连续工作一年以上的条件，就有权享受带薪年休假，且年休假期间工资收入与正常工作期间相同。
《职工带薪年休假条例》
- 第二条明确了适用范围，即机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。
- 第五条规定了年休假天数的计算方式，以及对于应休未休年休假的处理（按日工资的300%支付报酬）。但此条款并未提及职工休完年假后离职需扣回已休年假的情况。
《企业职工带薪年休假实施办法》
- 第十二条规定：“用人单位与职工解除或者终止劳动合同时，当年度未安排职工休满应休年休假天数的，应当按照职工当年已工作时间折算应休未休年休假天数并支付未休年休假工资报酬，但折算后不足1整天的部分不支付未休年休假工资报酬。用人单位当年已安排职工年休假的，多于折算应休年休假的天数不再扣回。”这一规定表明，如果员工在离职时还有未休的年假，单位应当支付相应的未休年休假工资报酬；反之，如果员工已经休完了年假，单位则无权扣回。
二、实际操作中的注意事项
年假天数的计算
- 年假天数的计算通常基于员工的累计工作年限和在本单位的工作年限。具体天数可能因地区和公司政策而异，但一般遵循国家法律法规的规定。
离职时的年假处理
- 如果员工在离职前已经休完了所有应休的年假，那么单位无需再支付任何未休年休假工资报酬，也无权扣回已休年假工资。
- 如果员工在离职时还有未休的年假，单位应当按照法律规定支付相应的未休年休假工资报酬。
避免纠纷
- 为了避免不必要的纠纷，建议双方在劳动合同中明确约定年假的相关条款，包括年假天数、休假时间、未休年假的处理方式等。
- 在员工离职时，双方应当就年假问题进行清算，确保没有遗漏或争议。
三、特殊情况说明
- 尽管一般原则是不扣回已休年假，但若劳动合同或公司规章制度中有特殊约定（如某些特定行业或岗位可能存在的特殊规定），且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么在实际操作中可能需要遵循这些特殊约定。不过，这种情况较为少见，且通常需要经过劳动者的同意。
四、举例说明
- 以小李为例，其在某公司工作3年，按规定每年可享受5天年假。小李在当年已休完5天年假后提出辞职。根据前述法律法规，公司不得因小李辞职而扣回其已休的5天年假工资或以其他形式要求补偿。
总结：综上所述，从法律角度来看，员工年假休完后辞职并不需要扣回已休的年假工资或返还年假天数。这是由《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》等法律法规所明确保障的劳动者权益。当然，在具体案件中还需考虑劳动合同及公司规章制度的特殊约定，但在无特殊约定的情况下，劳动者有权享受他们应得的带薪年休假，即使在离职后也不应被扣回。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。