结论：当事人约定了结算方式，并不直接决定乙方是否可以提出鉴定申请，这主要取决于双方合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果合同中明确约定了结算方式，并且也规定了在该结算方式下乙方有权提出鉴定申请的条件或情形，那么乙方在符合这些条件或情形时，当然可以提出鉴定申请。
   • 例如，合同可能约定：“结算方式为甲方审核后付款，但如乙方对甲方的审核结果有异议，可在收到审核结果后XX日内提出鉴定申请，鉴定费用由责任方承担。”在此情况下，乙方对审核结果有异议时，即可依据合同提出鉴定申请。

2. 法律法规的补充作用：

   • 如果合同中没有明确约定乙方是否可以提出鉴定申请，那么需要参考相关法律法规的规定。
   • 在合同纠纷中，如果双方对结算金额存在争议，且该争议无法通过协商解决，一方或双方可能会寻求通过鉴定来确定结算金额。这种情况下，虽然合同没有明确约定，但根据《民事诉讼法》等相关法律法规，当事人有权申请鉴定以查明事实。

3. 鉴定申请的提出条件：

   • 无论合同是否有约定，乙方提出鉴定申请通常需要满足一定的条件，如存在争议的事实、该事实需要通过鉴定才能查明、鉴定申请在合理的期限内提出等。
   • 例如，如果乙方认为甲方的结算金额计算错误，但无法提供直接证据证明，此时乙方可能需要通过鉴定来证明其主张。然而，如果乙方在合同约定的异议期限内未提出异议，也未提出鉴定申请，那么可能视为其接受了甲方的结算金额。

4. 实际操作建议：

   • 对于乙方而言，如果希望在结算过程中保留提出鉴定申请的权利，建议在合同中明确约定相关条款，包括鉴定申请的条件、期限、费用承担等。
   • 如果合同中没有约定或约定不明确，乙方在提出鉴定申请前应仔细评估争议的事实和法律依据，确保鉴定申请的必要性和合理性。同时，乙方也应注意在合理的期限内提出鉴定申请，以免丧失相关权利。

总结与建议：当事人约定了结算方式并不直接决定乙方是否可以提出鉴定申请。这主要取决于合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。因此，建议乙方在签订合同时仔细审查合同条款，确保自身权益得到充分保障。如果合同中没有约定或约定不明确，乙方在提出鉴定申请前应咨询专业律师，评估争议的事实和法律依据，确保鉴定申请的必要性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。