结论：在一审两罪判一罪且存在超期羁押的情况下，可以申请国家赔偿，但需满足一定条件并遵循法定程序。以下从多个角度详细分析：
一、超期羁押与国家赔偿的关联性
根据《中华人民共和国国家赔偿法》第十七条，行使侦查、检察、审判职权的机关以及看守所、监狱管理机关及其工作人员在行使职权时有下列侵犯人身权情形之一的，受害人有取得赔偿的权利：
- 违反刑事诉讼法的规定对公民采取拘留措施的，或者依照刑事诉讼法规定的条件和程序对公民采取拘留措施，但是拘留时间超过刑事诉讼法规定的时限，其后决定撤销案件、不起诉或者判决宣告无罪终止追究刑事责任的；
- 对公民采取逮捕措施后，决定撤销案件、不起诉或者判决宣告无罪终止追究刑事责任的；
- 依照审判监督程序再审改判无罪，原判刑罚已经执行的；
- 刑讯逼供或者以殴打、虐待等行为或者唆使、放纵他人以殴打、虐待等行为造成公民身体伤害或者死亡的；
- 违法使用武器、警械造成公民身体伤害或者死亡的。
超期羁押属于上述第1、2项的延伸情形。若一审判决后，被告人被羁押的时间超过法定时限（如逮捕后羁押期限届满未变更强制措施，或一审判决未生效前继续羁押但无合法依据），且后续被改判无罪或终止追究刑事责任，则符合国家赔偿的构成要件。
二、一审两罪判一罪的特殊性
若一审法院将两罪合并为一罪判决，需分情况讨论：
- 若后续被改判无罪：例如二审或再审撤销原判、宣告无罪，则超期羁押部分可直接申请赔偿。
- 若后续被改判轻罪或部分罪名不成立：需区分羁押期限是否合法。若原羁押期限针对两罪总和，但改判后实际应羁押期限缩短（如原判合并执行5年，改判后仅需执行3年），则超期部分可申请赔偿。
- 若一审判决已生效且未被撤销：需审查羁押期限是否超过一审判决确定的刑期。若未超过，则不构成超期羁押；若超过（如判决生效后未及时释放），则超期部分可申请赔偿。
三、申请国家赔偿的具体条件
- 主体资格：赔偿请求人需为受侵害的公民本人，或其继承人、其他有扶养关系的亲属（若公民死亡）。
- 程序要求：
- 需先向赔偿义务机关（通常为作出错误羁押决定的机关，如法院、检察院）提出赔偿申请；
- 若被拒绝，可在收到决定之日起30日内向上一级机关申请复议；
- 若复议结果仍不满意，可在收到复议决定之日起30日内向复议机关所在地的同级人民法院赔偿委员会申请作出赔偿决定。
- 证据材料：需提供证明超期羁押的证据（如羁押文书、判决文书、释放证明等），以及证明自身无罪或罪名不成立的法律文书（如二审判决书、再审裁定书）。
四、实务建议
- 及时固定证据：保留所有与羁押相关的法律文书，记录羁押起止时间，并核对是否超过法定时限（如逮捕后一般羁押期限为2个月，可延长至7个月）。
- 分阶段主张权利：若一审判决后未立即申请赔偿，可在后续改判无罪或终止追究刑事责任后，再行主张超期羁押的赔偿。
- 咨询专业律师：国家赔偿案件涉及程序复杂，建议委托律师协助计算赔偿金额（如每日赔偿金按国家上年度职工日平均工资计算）、准备申请材料，并参与赔偿协商或诉讼。
示例：
张某因涉嫌两罪被逮捕，羁押期限本应为6个月，但一审判决后未及时释放，实际羁押10个月。后二审改判一罪且刑期缩短，张某可就超期的4个月申请国家赔偿，每日赔偿金按最新标准计算（如2023年为436.89元/日，4个月约120天，赔偿总额约52,426.8元）。
如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询。