企业注销时合作合同未到期，一般需根据合同约定及法律规定承担相应责任，具体处理方式需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同有明确约定的情况
如果合作合同中明确约定了在企业注销等特定情况下合同的处理方式，比如提前终止合同的违约责任、赔偿范围等，那么双方应当按照合同约定来执行。
举例：合同中约定，若一方因注销等原因需提前终止合同，应向另一方支付相当于合同剩余期限内预期收益一定比例的违约金。在此情况下，注销企业就需按照这一约定向合作方支付违约金。
二、合同无明确约定的情况
如果合作合同中没有明确约定企业注销时合同的处理方式，那么就需要依据相关法律规定来处理。
根据《民法典》相关规定
企业注销导致合同无法继续履行的，一般构成违约。注销企业应当承担违约责任，赔偿合作方因此遭受的损失。损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违反合同一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违反合同可能造成的损失。
举例：若合作合同是关于共同开发一款产品，企业注销导致开发工作无法继续，合作方因此失去了预期的市场收益。在此情况下，注销企业就需要赔偿合作方这部分预期的市场收益损失，但赔偿金额需在合理预见范围内。
考虑企业注销的具体原因和程序
如果企业是因破产等原因注销，且已经按照法定程序进行了清算，那么在清算过程中，合作合同的债权应当作为破产债权进行申报和处理。
举例：企业因资不抵债进入破产程序并注销，合作方作为债权人，需在规定的期限内向破产管理人申报债权。破产管理人会根据破产财产的分配方案，按照法定顺序对债权进行清偿。
如果企业是因合并、分立等原因注销，且合并、分立后的主体承继了原企业的权利和义务，那么合作合同应当由承继主体继续履行。
举例：企业A与企业B合并为新的企业C，并注销了企业A和企业B。在此情况下，企业A与企业B之前签订的合作合同应当由企业C继续履行。
三、实际操作建议
审查合同条款：首先，仔细审查合作合同中的相关条款，特别是关于合同终止、违约责任和赔偿等方面的约定。
协商解决：如果合同中有明确约定或双方能够就合同处理方式达成一致意见，最好通过协商的方式解决争议，以节省时间和成本。
寻求法律帮助：如果合同中没有明确约定或双方无法就合同处理方式达成一致意见，建议及时寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决争议。
在企业注销时合作合同未到期的情况下，双方应当首先审查合同条款，然后根据合同约定和法律规定来处理合同争议。如有需要，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。