企业违反制度扣工资是违法的，我国法律对此有明确的规定和相应的处罚措施。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律对企业扣工资行为的明确禁止
《中华人民共和国劳动法》：
- 第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一条款直接禁止了企业无故克扣工资的行为。
- 第九十一条进一步规定，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
《中华人民共和国劳动合同法》：
- 第三十条强调，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若拖欠或未足额支付，劳动者可依法向当地人民法院申请支付令。
- 第八十五条详细列举了用人单位未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬等情形的法律责任，包括由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿，并可能加付赔偿金。
《工资支付暂行规定》：
- 第十五条明确指出，用人单位不得克扣劳动者工资，除非符合特定情况（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等），其他克扣工资行为均是违法的。
二、企业合法扣工资的例外情况
虽然法律禁止企业无故克扣工资，但也存在一些例外情况，即企业可以依法代扣劳动者工资的情形，包括：
- 用人单位代扣代缴的个人所得税；
- 用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
- 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
- 法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
若企业扣工资不属于上述例外情况，则构成违法。
三、企业违法扣工资的法律后果
- 支付工资报酬和经济补偿：企业需支付劳动者被克扣的工资报酬，并可能需支付经济补偿。
- 加付赔偿金：若企业逾期不支付工资报酬和经济补偿，劳动行政部门可责令企业按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
- 劳动者维权途径：
- 协商：劳动者可首先与企业协商解决。
- 投诉举报：若协商无果，可向当地劳动监管机构投诉举报。
- 劳动仲裁：劳动者还可向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。
- 诉讼：对仲裁结果有异议的，劳动者可向当地人民法院提起诉讼。
四、具体案例与法律建议
案例：假设某企业因员工违反内部规章制度而扣除了其一个月的工资，但该规章制度并未明确规定此类违规行为将导致工资扣除，且扣除的工资不属于上述合法代扣的情形。在此情况下，企业的行为即构成违法。
法律建议：
- 劳动者：应了解自己的权益和维权途径，遇到企业违法扣工资时，及时与企业协商或向相关部门投诉举报。
- 企业：应严格遵守相关法律法规，制定合法合理的规章制度，并确保规章制度的执行符合法律规定。若需对员工进行处罚，应确保处罚措施合法合规，避免侵犯员工的合法权益。
综上所述，企业违反制度扣工资是违法的，我国法律对此有明确的规定和相应的处罚措施。劳动者应了解自己的权益和维权途径，企业也应严格遵守相关法律法规，确保合法合规经营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。