结论：被迫离职后公司认定自动离职是否合法，需根据具体情况判断，一般来说，若公司未依法履行相应程序或未提供合理理由，则该认定不合法。
分析说明：
被迫离职与自动离职的区别：
- 被迫离职通常指的是员工因公司违法行为（如拖欠工资、未提供劳动条件等）或不可抗力因素（如公司破产、解散等）而不得不离职的情况。
- 自动离职则是指员工在未与公司协商一致，也未按照法定程序提前通知的情况下，擅自离开工作岗位的行为。
公司认定自动离职的合法性：
- 若公司存在违法行为导致员工被迫离职：在此情况下，员工有权解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。公司若将此认定为自动离职，显然是不合法的，因为员工离职是由于公司的违法行为所致。
- 若员工因个人原因擅自离职：如果员工确实是因为个人原因，如找到更好的工作、家庭原因等，而未经公司同意擅自离职，那么公司将其认定为自动离职可能是合法的。但即便如此，公司也应按照法定程序处理员工的离职事宜，如结算工资、办理离职手续等。
- 公司未履行法定程序：无论员工是因何种原因离职，公司都应按照《劳动合同法》等相关法律法规的规定，履行相应的程序，如提前通知、结算工资、办理社保转移等。如果公司未履行这些程序，而直接将员工认定为自动离职，那么这种认定可能是不合法的。
法律后果：
- 如果公司非法认定员工自动离职，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司支付经济补偿、赔偿金等。
- 在仲裁过程中，员工需要提供相关证据证明自己是被迫离职，如公司拖欠工资的证据、未提供劳动条件的证据等。
行动建议：
- 收集证据：如果你认为自己是被迫离职，而公司却认定为自动离职，那么你应尽快收集相关证据，如工资条、工作记录、与公司沟通的记录等，以证明自己的离职原因。
- 申请劳动仲裁：在收集到足够证据后，你可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司支付经济补偿、赔偿金等。
- 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，建议你咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
特殊场景：
- 如果公司存在严重违法行为，如恶意拖欠工资、非法解雇等，你还可以考虑向劳动监察部门投诉或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
相关法规：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，员工因公司违法行为而解除劳动合同的，公司应支付经济补偿。
- 公司未按照法定程序处理员工离职事宜的，可能面临劳动行政部门的处罚。
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