结论：老板因让你休息一天而扣发一天工资的行为，通常是不合法的，但具体还需根据休息的性质和公司的规章制度来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、休息性质与工资扣除的合法性
法定休息日：
- 如果休息日属于国家法定节假日或公司依法安排的休息日（如周末），那么员工在休息日期间享有休息的权利，且公司不得因此扣除工资。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。但此条款主要针对休息日加班的情况，对于正常休息日，公司应支付正常工资，不得扣除。
事假或病假：
- 如果休息日是员工因个人原因（如事假）或健康原因（如病假）而申请的休息，那么公司可能会根据规章制度扣除相应天数的工资。但扣除的比例和方式需符合法律法规和公司规章制度的规定。
- 特别说明：对于病假，根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在医疗期内享有病假工资，且病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。
公司单方面安排休息：
- 如果公司因经营需要或其他原因单方面安排员工休息，且未提前与员工协商或未按照法律法规和公司规章制度支付工资，那么公司扣除工资的行为可能是违法的。
二、公司规章制度与工资扣除
- 规章制度合法性：公司规章制度中关于工资扣除的规定必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。如果规章制度中明确规定了因休息而扣除工资的情况，且该规定不违反法律法规，那么公司可能有权按照规章制度执行。
- 员工知情权：公司规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知。如果员工对规章制度不知情或未同意，那么公司不得依据该规章制度扣除工资。
三、建议与行动
与公司沟通：
- 首先，建议与公司人力资源部门或上级领导进行沟通，了解扣除工资的具体原因和依据。
- 如果公司无法提供合理的解释或依据，或者解释和依据违反法律法规，那么员工可以进一步采取行动。
收集证据：
- 员工应收集与工资扣除相关的证据，如工资条、考勤记录、公司规章制度等。
- 这些证据将有助于员工在后续维权过程中证明自己的权益受到侵害。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通无果，或者公司拒绝改正违法行为，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在投诉或申请仲裁前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
最后，作为劳动者，你有权获得应得的工资报酬。如果老板因让你休息一天而扣发工资，且该行为违反了法律法规或公司规章制度，你有权维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。