结论前置：员工在备孕期间请假太多影响工作，公司一般不可以直接辞退，但在特定条件下可能合法解除劳动合同。以下从不同角度进行分析：

1. 备孕期间员工的特殊保护

根据《中华人民共和国妇女权益保障法》和《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，女性员工在孕期、产期和哺乳期（简称“三期”）享有特殊的法律保护。备孕期间虽不属于“三期”的严格范畴，但法律对女性员工的生育权益有整体保护倾向，公司不能仅因员工备孕而对其采取不利措施。

2. 公司辞退员工的合法条件

公司若想辞退员工，必须符合《中华人民共和国劳动合同法》中规定的合法解除劳动合同的情形，主要包括：

• 员工严重违反公司规章制度：如果员工请假过多且违反了公司明确的请假制度，如未经批准擅自离岗、虚假请假等，且公司能提供充分证据证明，公司可能可以依据规章制度辞退员工。但需注意，规章制度必须合法、合理且已向员工公示。
• 员工不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位仍不能胜任：如果员工因请假过多导致无法完成工作任务，且经过培训或调整岗位后仍无法胜任，公司可以解除劳动合同。但此情形下，公司需承担举证责任，证明员工确实不能胜任工作。
• 劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行：如公司因经营困难需要裁员等，但此情形与员工备孕请假无直接关联。

3. 备孕请假与辞退的关联性分析

• 若请假合法且合理：如员工因身体不适需要备孕检查或治疗，且已按照公司规定履行请假手续，公司不能仅因请假多而辞退员工。否则，可能构成违法解除劳动合同，需承担相应的法律责任。
• 若请假不合法或不合理：如员工频繁请假且无正当理由，或未经批准擅自离岗，公司可以依据规章制度进行处理。但处理时需谨慎，确保不侵犯员工的合法权益，尤其是避免因员工备孕而对其产生歧视。

4. 法律建议

• 对员工而言：在备孕期间，应尽量合理安排请假时间，确保不影响正常工作。如需请假，应提前与公司沟通并履行请假手续。同时，保留好相关医疗证明等证据，以备不时之需。
• 对公司而言：在处理备孕员工请假问题时，应秉持公平、公正的原则，避免对员工产生歧视。如需辞退员工，必须确保符合法律法规的规定，并承担相应的举证责任。否则，可能面临法律纠纷和赔偿风险。

进一步思考：在实际操作中，公司应建立健全的规章制度和请假流程，明确请假的条件和程序。同时，加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识。员工也应了解自己的合法权益和维权途径，在遇到问题时及时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。