结论：被挂靠人已付挂靠人工程款超过业主最终结算款项时，是否可以要求挂靠人返还，需根据具体情况分析，主要包括合同约定、实际履行情况、是否存在过错等因素。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合同约定角度：

   • 若合同中有明确约定：如果被挂靠人与挂靠人之间的合同中明确约定了工程款的支付方式、结算方式以及超额支付的处理方式，那么双方应严格按照合同约定执行。若合同中约定了超额支付时挂靠人需返还的条款，被挂靠人有权依据合同要求挂靠人返还超额部分。
   • 若合同中无明确约定：若合同中未对超额支付的情况作出明确约定，则需依据相关法律法规及行业惯例进行判断。

2. 实际履行情况角度：

   • 若实际履行与合同一致：如果双方在实际履行过程中均按照合同约定执行，且被挂靠人支付工程款的行为符合合同约定，但因业主最终结算款项低于已支付款项而出现超额支付，此时被挂靠人可尝试与挂靠人协商返还超额部分。若协商无果，被挂靠人可能需通过法律途径解决，但胜诉与否将取决于具体证据和法院判决。
   • 若实际履行与合同不一致：如果双方在实际履行过程中存在变更合同内容、调整支付方式等情形，且这些变更未得到双方书面确认或违反相关法律法规，那么被挂靠人要求挂靠人返还超额部分可能面临一定困难。此时，被挂靠人需承担举证责任，证明超额支付是由于挂靠人的过错或违约行为导致的。

3. 过错与责任角度：

   • 若挂靠人存在过错：如果超额支付是由于挂靠人提供虚假资料、隐瞒重要信息或违反合同约定等过错行为导致的，被挂靠人有权要求挂靠人承担返还责任，并可能要求其赔偿因此造成的损失。
   • 若被挂靠人存在过错：如果超额支付是由于被挂靠人自身管理不善、审核不严或违反合同约定等过错行为导致的，那么被挂靠人可能难以要求挂靠人返还超额部分，甚至可能需承担一定的法律责任。

4. 法律后果与建议：

   • 法律后果：若被挂靠人要求挂靠人返还超额部分未果，可能需通过诉讼或仲裁等法律途径解决。在此过程中，被挂靠人需承担举证责任，证明超额支付的事实及挂靠人的过错或违约行为。若法院或仲裁机构认定被挂靠人的主张成立，挂靠人需承担返还责任及可能的其他法律责任。
   • 建议：为避免类似纠纷的发生，建议被挂靠人在与挂靠人签订合同时明确约定工程款的支付方式、结算方式及超额支付的处理方式；在实际履行过程中加强管理、严格审核，确保支付行为符合合同约定及相关法律法规；在出现超额支付情况时及时与挂靠人协商解决，若协商无果则及时寻求法律援助。

总结：被挂靠人已付挂靠人工程款超过业主最终结算款项时，是否可以要求挂靠人返还需根据合同约定、实际履行情况、是否存在过错等因素综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。