企业员工虚填工票属于违反企业规章制度甚至可能涉及违法犯罪的行为，企业可根据具体情况采取相应处理措施，具体如下：

1. 依据企业内部规章制度处理
   • 调查核实：企业发现员工虚填工票后，首先要进行全面、客观的调查，收集相关证据，如工票原件、工作记录、监控视频、同事证言等，以确定员工虚填工票的事实、情节轻重以及造成的后果等。例如，通过查看监控发现员工在某时间段根本没有在相应工作地点工作，但却填写了该时间段的工票。
   • 按照规定处罚：如果企业有明确的关于虚填工票等违规行为的规章制度，且该制度经过民主程序制定、公示或告知了员工，那么企业可以依据制度规定对员工进行处罚。处罚方式可能包括警告、罚款、扣发奖金、降职降薪等。比如，企业制度规定虚填工票一次给予警告处分，并扣除当月绩效奖金的20%；多次虚填或情节严重的，可予以辞退。
2. 涉及违法犯罪的处理
   • 民事赔偿：如果员工虚填工票的行为给企业造成了经济损失，如虚报工作时长导致企业多支付了工资、奖金等，企业有权要求员工进行赔偿。企业可以通过与员工协商解决赔偿问题，如果协商不成，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。例如，员工通过虚填工票多领取了5000元工资，企业可以要求其返还这5000元。
   • 刑事责任：在极端情况下，员工虚填工票的行为可能构成犯罪。如果员工虚填工票是为了骗取企业财物，数额较大的，可能构成诈骗罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条规定，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。企业发现员工涉嫌犯罪的，应及时向公安机关报案，由公安机关依法进行侦查、起诉和审判。
3. 完善企业管理措施
   • 加强制度建设：企业应进一步完善工票管理制度，明确工票的填写规范、审核流程等，确保工票的真实性和准确性。例如，规定工票必须由员工本人填写，经上级主管审核签字确认后方可生效；定期对工票进行抽查和核对等。
   • 开展培训教育：加强对员工的法律法规和职业道德培训，提高员工的法律意识和诚信意识，让员工认识到虚填工票的危害和后果。可以通过组织专题培训、案例分析等方式进行教育。
   • 建立监督机制：建立健全内部监督机制，鼓励员工之间相互监督和举报虚填工票等违规行为。对举报属实的员工给予一定的奖励，同时保护举报人的合法权益，防止打击报复。

企业在处理员工虚填工票问题时，要确保处理程序合法合规，避免因处理不当而引发劳动纠纷。如果你还有其他关于企业劳动管理方面的法律问题，可以直接向我咨询。