员工协助公司虚开发票属于违法行为，将面临行政处罚甚至刑事处罚，公司也可能承担相应法律责任，员工需立即停止协助行为并主动向相关部门说明情况。以下从不同角度详细分析：
从员工个人角度
- 法律责任
- 行政责任：根据《中华人民共和国发票管理办法》规定，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。员工协助公司虚开发票，即便不是直接开具发票的人，也可能因参与其中而被认定为共同违法，面临上述行政处罚。
- 刑事责任：如果虚开发票行为情节严重，构成犯罪的，员工可能触犯《中华人民共和国刑法》中的虚开发票罪。根据该法条规定，虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。员工若被认定为直接责任人员，将承担相应的刑事责任。
- 应对措施
- 立即停止协助行为：一旦发现自己协助公司虚开发票，应第一时间停止参与，避免进一步陷入违法犯罪的泥潭。
- 主动向相关部门说明情况：可以向税务机关或公安机关主动交代自己参与虚开发票的事实，争取从轻或减轻处罚。如果是在被胁迫、诱骗等情况下参与的，如实说明情况有助于证明自己的主观恶性较小。
从公司角度
- 法律责任
- 行政责任：公司作为虚开发票的主体，将面临税务机关的严厉处罚。除了被没收违法所得外，还会根据虚开发票的金额大小被处以高额罚款。同时，公司的纳税信用等级也会受到影响，这可能会对公司的日常经营、融资等方面产生不利影响。
- 刑事责任：若虚开发票行为构成犯罪，公司作为单位犯罪的主体，将被判处罚金。公司的法定代表人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员也将面临刑事处罚。
- 应对措施
- 内部整改：公司应立即停止虚开发票的行为，对内部的财务管理和发票开具流程进行全面审查和整改，建立健全的内部控制制度，防止类似行为再次发生。
- 配合调查：积极配合税务机关或公安机关的调查工作，如实提供相关资料和信息，争取从轻处理。
从其他相关方角度（如交易对方）
如果交易对方明知公司虚开发票仍与之进行交易，也可能面临一定的法律风险。税务机关在查处虚开发票案件时，会对整个交易链条进行调查，交易对方可能需要配合调查，并提供相关证据证明自己的交易真实性。如果无法证明交易的真实性，可能会被认定为与虚开发票行为有关联，从而面临税务处罚等风险。
如果你有进一步的疑问或需要更详细的法律指导，可以直接向我咨询。