针对您提出的“长时间加班在工作岗位脑干出血，两个月后死亡，是否认定工伤”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

1. 工伤认定的基本条件：

   • 根据《工伤保险条例》第十五条第（一）项的规定，职工在工作时间和工作岗位上，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。这是工伤认定中的一个重要条款，也是判断您所描述情况是否构成工伤的关键依据。

2. 具体情形分析：

   • 在您所描述的情况中，职工是在长时间加班的工作岗位上突发脑干出血，但并未在48小时内死亡，而是在两个月后死亡。这一情形并不直接符合《工伤保险条例》第十五条第（一）项中“48小时之内经抢救无效死亡”的规定。
   • 然而，如果能够证明脑干出血与长时间加班的工作环境、工作强度等存在直接的因果关系，并且这种关系符合职业病的相关认定标准（尽管脑干出血通常不被直接视为职业病），那么理论上仍有可能被认定为工伤。但这种情况下的证明难度较大，需要依靠专业的医学鉴定和相关证据支持。

3. 申请工伤认定的材料与流程：

   • 若要申请工伤认定，需由用人单位或职工近亲属向当地社会保险行政部门提出申请，并提供相关证明材料，包括但不限于劳动合同、医疗诊断证明、加班相关证据等。
   • 社会保险行政部门会根据调查核实的情况作出是否认定为工伤的决定。

4. 特殊情况的考虑与建议：

   • 考虑到您所描述的情况并不直接符合工伤认定的典型条件，但职工的死亡确实与工作有关联（长时间加班），建议尽可能收集和保留相关证据，如加班记录、医疗证明、同事证言等，以便在必要时维护自己的合法权益。
   • 同时，也可以考虑通过协商、调解等方式与用人单位沟通，寻求合理的解决方案。如果协商、调解无果，还可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

结论与建议：

• 在您所描述的情况下，由于职工并未在48小时内死亡，因此直接认定为工伤的难度较大。但如果您能够证明脑干出血与长时间加班存在直接的因果关系，并且符合职业病的相关认定标准（尽管这一证明过程可能较为复杂和困难），那么仍有可能被认定为工伤。
• 建议您尽可能收集和保留相关证据，并咨询专业律师（即我本人，张央沁佚律师，专注于劳动纠纷领域）以获取更准确的法律意见和指导。同时，也可以考虑与用人单位进行协商、调解或依法申请仲裁、提起诉讼等方式来维护自己的合法权益。