当公司面临转型，并且涉及到孕妇员工的赔偿问题时，这确实是一个需要细致处理的情况。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，我们可以从以下几个方面来详细解答您的疑问：
一、赔偿标准与计算方式
经济补偿金：
- 计算基数：经济补偿金是按照劳动者在本单位工作的年限来计算的。每满一年，支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资作为经济补偿。
- 月工资定义：这里的月工资指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。如果劳动者在公司工作的时间不足十二个月，那么就按照实际工作的月数来计算平均工资。
- 特殊保护：特别需要注意的是，根据《劳动合同法》第四十二条的规定，用人单位不得因女职工怀孕而解除劳动合同。如果公司违法解除了与孕妇的劳动合同，那么需要按照经济补偿标准的二倍来支付赔偿金，即遵循“2N”原则。
“三期”待遇保障：
- 孕期、产期、哺乳期：在这三个特殊时期，公司需要继续支付孕妇的工资以及缴纳社保，直到相应的期限结束。或者，也可以与公司协商一次性支付至哺乳期满的工资及社保费用。
- 生育津贴：如果公司已经为孕妇缴纳了生育保险，那么孕妇可以申领生育津贴。如果公司没有缴纳生育保险，那么相关的费用就需要由公司来承担。
代通知金（如适用）：
- 如果公司没有提前三十日以书面形式通知孕妇解除劳动合同，那么还需要额外支付一个月的工资作为代通知金。
二、操作流程与注意事项
确认劳动关系状态：
- 首先，需要确认劳动合同是否仍然存续，以及公司是否已经进入了破产清算程序（如果公司是转型而非直接倒闭，这一步可能略有不同，但确认劳动关系状态仍然是必要的）。
与公司协商：
- 主动与公司沟通赔偿方案，明确要求公司依法支付经济补偿金、“三期”待遇等。
申请劳动仲裁：
- 如果与公司协商没有达成一致，可以向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。在申请时，需要提供劳动合同、工资流水等相关证据来支持自己的诉求。
参与相关程序（如适用）：
- 如果公司进入了破产清算程序，那么孕妇作为职工，其债权在破产清算中是优先于普通债权受偿的。但需要注意的是，清偿顺序可能会受到一定的限制。
法律救济途径：
- 如果对劳动仲裁的结果不满意，可以在十五日内向法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
三、示例说明
假设有一位孕妇在公司工作了两年半，月薪为8000元。如果公司因为转型而需要与她解除劳动合同，那么她应该获得的赔偿如下：
- 经济补偿金：2.5个月 × 8000元 = 20,000元
- “三期”待遇：需要支付至哺乳期结束的工资及社保费用（具体金额需要根据实际情况来计算）
希望以上解答能够帮助您更好地理解公司转型时孕妇员工的赔偿问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。