公司申请歇业时，员工的赔偿问题确实可能发生变化，但具体变化取决于歇业的性质、程序以及员工与公司之间的合同约定等因素。以下从不同角度为你详细分析：
一、歇业性质与程序对员工赔偿的影响
合法歇业：
- 如果公司按照法定程序申请歇业，比如经过股东会或董事会决议，并依法办理了歇业登记手续，那么公司需要按照相关法律法规的规定，对员工进行妥善安置或支付相应的经济补偿。
- 根据《劳动合同法》的规定，公司歇业导致劳动合同无法继续履行的，公司应当向员工支付经济补偿。经济补偿的标准通常按照员工在公司的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
非法歇业：
- 如果公司未经法定程序擅自歇业，或者歇业后未依法对员工进行安置或支付经济补偿，那么公司可能面临法律责任。员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
二、员工与公司合同约定对赔偿的影响
- 如果员工与公司之间的劳动合同中明确约定了歇业时的赔偿条款，那么公司应当按照合同约定履行赔偿义务。
- 如果合同中没有明确约定，那么公司应当按照法律法规的规定进行赔偿。
三、歇业期间员工权益的保障
工资支付：
- 在歇业期间，如果公司仍然保留员工的劳动关系，那么公司应当按照法律法规的规定支付员工工资或生活费。
社会保险和住房公积金：
- 公司歇业期间，应当继续为员工缴纳社会保险和住房公积金，确保员工的社保权益不受影响。
员工安置：
- 公司歇业后，应当积极与员工协商安置方案，如提供转岗机会、推荐就业等，以减少对员工的影响。
四、实际操作中的建议
员工方面：
- 在公司申请歇业时，员工应当及时了解歇业的性质、程序以及公司的安置方案。
- 如果公司未依法进行安置或支付经济补偿，员工应当及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
公司方面：
- 在申请歇业前，公司应当充分评估歇业对员工的影响，并制定合理的安置方案。
- 歇业期间，公司应当继续履行对员工的法定义务，如支付工资、缴纳社保等。
举例说明：假设某公司因经营不善决定申请歇业，并依法办理了歇业登记手续。该公司有员工100人，平均工作年限为5年，平均月工资为5000元。根据《劳动合同法》的规定，该公司应当向每位员工支付5个月工资的经济补偿，即每位员工应获得25000元的经济补偿。如果公司未依法支付，员工有权通过法律途径维护自己的权益。
总结来说，公司申请歇业时，员工的赔偿问题确实可能发生变化。但无论何种情况，公司都应当依法履行对员工的义务，确保员工的合法权益不受侵害。如果你或你身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更具体的法律建议。