在交通事故导致一人死亡且肇事者负主要责任，同时涉及二伤，并且已经获得了受害方的谅解书的情况下，关于检察院是否能办直诉（即作出不起诉决定），这并不是一个可以简单断定的问题。以下是对此问题的详细分析：

首先，谅解书在刑事诉讼中确实具有一定的作用。它通常被视为肇事者认罪、悔罪态度的一种体现，可能在量刑时被法院视为从轻情节。然而，谅解书并不直接决定检察院是否起诉。检察院在决定是否起诉时，会依据我国《刑事诉讼法》的相关规定，全面考量案件的犯罪情节、后果、社会危害性等多方面因素。

对于交通事故致人死亡且负主要责任的案件，由于这类案件往往涉及公共安全和社会秩序，检察院在决定是否起诉时通常会更为谨慎。除非肇事者的行为情节显著轻微、危害不大，或者存在其他法定不起诉的情形（如犯罪已过追诉时效、经特赦令免除刑罚等），否则检察院很可能会提起公诉。

此外，即使检察院决定不起诉，这并不意味着肇事者就完全摆脱了法律责任。交通事故涉及的交通违法行为仍可能面临交通管理部门的行政处罚，如吊销机动车驾驶证，并在规定期限内不得重新考取。同时，受害者家属仍有权基于民事侵权责任要求肇事者承担相应的民事赔偿，包括丧葬费、死亡赔偿金、被扶养人生活费等。

因此，对于肇事者而言，即使获得了谅解书，也应积极配合司法机关的调查和处理，尽力减轻犯罪情节和社会危害性。可以通过积极赔偿、与受害方达成和解协议等方式来争取更好的法律结果，并在向检察院提交相关申请时详细陈述理由和事实。

综上所述，交通事故致一死二伤且肇事者负主要责任的案件中，谅解书虽有一定作用，但并不能确保检察院不起诉。肇事者和受害者家属都应充分了解相关法律程序和自身权利义务，以便做出正确的法律决策。