结论：在交通事故中负主要责任并致两人死亡的情况下，即使积极赔偿并获得谅解书，检察院仍有可能批捕。谅解书虽可作为量刑时的从轻情节考虑，但并不构成法定不批捕的依据。
详细分析：
刑事责任与谅解书的关系：
- 交通事故致人死亡，且肇事者负主要责任，这通常构成交通肇事罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，交通肇事罪的刑事责任并不因获得谅解书而自动免除。
- 谅解书是受害方对肇事者行为的一种谅解表示，它可以在量刑时作为从轻情节考虑，但并不能直接决定检察院是否批捕或起诉。
检察院批捕的决策依据：
- 检察院在决定是否批捕时，会全面考量案件的犯罪情节、后果、社会危害性等因素。在交通事故致两人死亡的案件中，由于后果严重，社会危害性大，检察院通常会倾向于批捕。
- 即使肇事者积极赔偿并获得谅解书，这只能作为量刑时的从轻情节，而不能作为不批捕的直接依据。
积极赔偿与谅解书的作用：
- 积极赔偿和获得谅解书表明肇事者有一定的悔罪表现，这有助于在量刑时争取从轻处理。
- 然而，这并不意味着肇事者可以完全免除刑事责任。在严重交通事故中，检察院仍可能会提起公诉，并由法院根据具体情况判决刑罚。
可能的法律后果：
- 如果检察院批捕并提起公诉，肇事者将面临刑事审判，并可能被判处刑罚，如有期徒刑、拘役等。
- 同时，肇事者还需承担民事赔偿责任，包括赔偿受害者家属的丧葬费、死亡赔偿金、被扶养人生活费等。
建议与指导：
- 积极配合司法机关：肇事者应积极配合司法机关的调查和处理，如实陈述事实，提供相关证据。
- 尽力减轻犯罪情节：通过积极赔偿、与受害方达成和解协议等方式，尽力减轻犯罪情节和社会危害性，争取更好的法律结果。
- 了解自身权利义务：肇事者及其家属应充分了解相关法律程序和自身权利义务，以便做出正确的法律决策。
- 寻求专业法律帮助：在处理此类复杂案件时，建议肇事者及其家属寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。
示例说明：
假设某肇事者在交通事故中负主要责任，并致两人死亡。事后，肇事者积极赔偿受害者家属，并获得了谅解书。然而，在检察院审查阶段，由于案件后果严重，社会危害性大，检察院仍决定批捕并提起公诉。最终，法院根据具体情况判决肇事者有期徒刑，并责令其承担民事赔偿责任。
总之，在交通事故中负主要责任并致两人死亡的情况下，即使积极赔偿并获得谅解书，也不能确保检察院不批捕。肇事者应充分了解相关法律程序和自身权利义务，并积极配合司法机关的处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。