结论：农村耕地老人和一个儿子确权在一起后，老人是有权通过立遗嘱的方式将耕地指定给另外一个儿子继承的，但具体能否实现还需考虑遗嘱的合法性、有效性以及是否侵犯了其他共有人的权益等因素。

分析说明：

1. 遗嘱的合法性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公民有权通过遗嘱处分自己的财产，包括农村耕地等不动产。因此，老人作为耕地的共有人之一，有权通过立遗嘱的方式指定其遗产的继承人。

2. 遗嘱的有效性：

   • 遗嘱的有效性取决于其是否符合法律规定的形式和实质要件。形式上，遗嘱可以是自书遗嘱、代书遗嘱、录音遗嘱、口头遗嘱或公证遗嘱等，但必须符合相应形式要求。实质上，遗嘱内容必须真实、合法，且不得违反公序良俗。
   • 在本题中，老人需要确保遗嘱内容明确、具体，且是其真实意愿的表达，同时不得侵犯其他共有人的合法权益。

3. 共有人权益的保护：

   • 如果耕地是老人和一个儿子共同确权的，那么该耕地属于共有财产。在立遗嘱时，老人只能处分自己所有的份额，而不能处分其他共有人的份额。
   • 如果老人试图通过遗嘱将整个耕地指定给另外一个儿子继承，这可能会侵犯到与老人共同确权的儿子的权益。在这种情况下，共同确权的儿子有权提出异议，并可能通过法律途径维护自己的权益。

4. 实际操作建议：

   • 老人可以在遗嘱中明确指定自己所有的耕地份额由另外一个儿子继承，同时确保遗嘱内容合法、有效。
   • 为了避免未来可能出现的纠纷，老人可以在立遗嘱前与其他共有人进行沟通，确保遗嘱内容得到他们的认可和理解。
   • 如果可能的话，老人可以寻求专业律师的帮助，以确保遗嘱的合法性和有效性。

特殊场景：

• 如果耕地是老人个人所有，只是与一个儿子共同使用或管理，那么老人有权通过遗嘱将整个耕地指定给另外一个儿子继承。但这种情况较为特殊，需要具体分析耕地的权属情况。

后续行动与注意事项：

• 老人应确保遗嘱的保存和传递安全，避免遗嘱丢失或被篡改。
• 在老人去世后，继承人应按照遗嘱的规定办理继承手续，并尊重其他共有人的权益。
• 如果发生纠纷或争议，继承人可以寻求法律途径解决，如通过诉讼或调解等方式维护自己的权益。

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