结论：在公安机关先发现虚开发票行为，5年后才刑事结案的情况下，是否还可以进行行政处罚，需要分情况讨论，关键在于是否已过行政处罚的追责时效以及是否已给予刑事处罚。具体分析如下：
关于行政处罚的追责时效
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。”
- 对于虚开发票的行为，若不属于涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的情形，则行政处罚的追责时效为二年；若属于该等情形，则追责时效为五年。
- 因此，如果公安机关在发现虚开发票行为后的二年内（或五年内，如涉及特定情形）未作出行政处罚决定，且之后也未因该行为给予刑事处罚的，原则上将不再给予行政处罚。但在此案例中，由于公安机关已经进行了刑事立案并最终结案，说明该行为已被发现并处于持续追责状态，因此追责时效的问题在此情境下可能不是主要障碍。
关于刑事处罚与行政处罚的衔接
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十五条：“违法行为构成犯罪，人民法院判处拘役或者有期徒刑时，行政机关已经给予当事人行政拘留的，应当依法折抵相应刑期。违法行为构成犯罪，人民法院判处罚金时，行政机关已经给予当事人罚款的，应当折抵相应罚金；行政机关尚未给予当事人罚款的，不再给予罚款。”
- 这意味着，如果虚开发票的行为已经构成犯罪并受到了刑事处罚（如有期徒刑、罚金等），那么对于同一行为，原则上不再给予行政处罚中的罚款等同类处罚。但是，如果刑事处罚中未涵盖所有应受行政处罚的方面（例如，刑事处罚中未涉及吊销许可证等行政处罚措施），则行政机关仍可以就未涵盖的部分进行行政处罚。
具体到本案例的情况
- 如果公安机关在发现虚开发票行为后，及时进行了刑事立案，并在五年后最终作出了刑事判决，那么对于该行为，原则上将不再给予与刑事处罚同类性质的行政处罚（如罚款）。
- 但是，如果刑事判决中未涉及某些行政处罚措施（如吊销发票领购簿、停止出口退税权等），且这些措施在行政处罚的范围内，那么行政机关仍可以就这些措施进行行政处罚。
- 另外，如果虚开发票的行为在刑事立案前或刑事判决后，又发现了新的违法行为或情节（如之前未发现的虚开金额、新的虚开行为等），且这些行为或情节未超过行政处罚的追责时效，那么行政机关仍可以就这些新发现的行为或情节进行行政处罚。
建议：在实际操作中，如果面临此类情况，建议及时咨询专业律师，以便更准确地判断是否还可以进行行政处罚，并了解具体的法律程序和可能面临的法律后果。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。