结论：发票低开且合同中以服务费形式收取，可能违反了《中华人民共和国发票管理办法》以及《中华人民共和国税收征收管理法》中的相关规定，具体涉及虚开发票、未按照规定开具发票以及偷税等违法行为。

详细分析：

1. 违反《中华人民共和国发票管理办法》：

   • 虚开发票：根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，任何单位和个人不得为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，即不得虚开发票。发票低开，即开具的发票金额低于实际交易金额，属于虚开发票的一种形式，因此违反了该条款。
   • 未按照规定开具发票：同样根据《中华人民共和国发票管理办法》，开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。发票低开显然没有如实开具发票金额，也违反了该规定。

2. 违反《中华人民共和国税收征收管理法》：

   • 偷税行为：根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。发票低开可能导致企业少列收入，从而少缴应纳税款，构成偷税行为。

法律后果：

• 对于虚开发票的行为，税务机关可以责令改正，并处以罚款；情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
• 对于偷税行为，税务机关将追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处以罚款；构成犯罪的，同样依法追究刑事责任。

建议：

• 立即纠正：如果发现发票低开的情况，应立即与开票方联系，要求重新开具符合实际交易金额的发票。
• 主动申报：如果已经因为发票低开而少缴了税款，应主动向税务机关申报并补缴税款及滞纳金，以避免更严重的法律后果。
• 加强内部管理：企业应加强对发票开具和财务管理流程的内部管理，确保所有交易都按照实际金额开具发票，并准确申报纳税。

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