结论：女方隐瞒重大疾病，通过民间调解协议离婚并退还彩礼，这一行为在法律上是否合法，需分情况讨论。一般来说，若调解协议内容合法且双方自愿，退还彩礼部分合法；但隐瞒重大疾病可能影响婚姻效力及离婚协议的公平性，需进一步审查。

分析：

1. 隐瞒重大疾病对婚姻效力的影响：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一方患有重大疾病的，应当在结婚登记前如实告知另一方；不如实告知的，另一方可以向人民法院请求撤销婚姻。这意味着，如果女方在婚前隐瞒了重大疾病，男方有权在知道或应当知道撤销事由之日起一年内请求撤销婚姻。

2. 民间调解协议离婚的合法性：

   • 民间调解协议离婚，通常指的是双方在没有通过法院诉讼的情况下，通过协商达成离婚协议，并办理离婚登记。这种离婚方式在法律上是允许的，但前提是双方必须自愿，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

3. 退还彩礼的合法性：

   • 彩礼的退还问题，通常与婚姻的效力及离婚的原因有关。如果婚姻因女方隐瞒重大疾病而被撤销，男方有权要求女方返还按照习俗给付的彩礼。如果双方是通过民间调解协议离婚，且协议中明确约定了彩礼的退还，那么这一约定在双方自愿且不违反法律强制性规定的情况下，是合法的。

4. 综合考量：

   • 在女方隐瞒重大疾病的情况下，如果男方选择通过民间调解协议离婚，并接受彩礼的退还，这一行为在法律上并非绝对非法。但关键在于，调解协议的内容是否合法、双方是否自愿，以及是否考虑了女方隐瞒重大疾病这一因素对婚姻效力和离婚协议公平性的影响。
   • 如果调解协议是在男方不知情或受胁迫、欺诈的情况下签订的，或者协议内容显失公平，那么男方有权在法定期限内请求撤销该协议或要求重新分割财产。

建议：

• 对于男方而言，如果发现女方在婚前隐瞒了重大疾病，应首先考虑是否请求撤销婚姻。如果决定离婚，应谨慎签订民间调解协议，确保协议内容合法、公平，并充分考虑自身权益。
• 对于女方而言，隐瞒重大疾病可能面临婚姻被撤销的风险，以及因此产生的法律责任。在离婚过程中，应如实告知对方相关情况，并积极配合协商，以达成公平合理的离婚协议。

后续行动：

• 如果双方对调解协议的内容或执行存在争议，可以寻求法律援助或向人民法院提起诉讼，以维护自身合法权益。

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