停工损失跟工程款是可以一起主张的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与依据
在建设工程合同中，工程款是承包人完成工程建设后应得的报酬，而停工损失则是由于发包人或其他原因导致工程停工，给承包人造成的额外损失。这两者都是基于建设工程合同关系产生的合法债权，承包人有权要求发包人进行赔偿或支付。
从法律原则上看，根据《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果发包人未按照约定支付工程款或导致工程停工，给承包人造成损失的，承包人有权要求发包人承担违约责任，包括支付工程款和赔偿停工损失。
实际操作与建议
合同条款审查：
- 首先，承包人应仔细审查建设工程合同中的相关条款，特别是关于工程款支付、停工责任和损失赔偿的约定。如果合同中有明确约定，承包人可以依据合同条款要求发包人支付工程款和赔偿停工损失。
证据收集与整理：
- 承包人需要收集并整理与停工损失和工程款相关的证据，如停工通知、损失计算清单、工程进度报告、已完工程量清单等。这些证据将有助于证明承包人的损失和应得的工程款。
协商与调解：
- 在提起诉讼或仲裁前，承包人可以尝试与发包人进行协商或调解，以达成和解协议。这不仅可以节省时间和成本，还可以维护双方的关系。
诉讼或仲裁：
- 如果协商或调解无果，承包人可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求发包人支付工程款和赔偿停工损失。在诉讼或仲裁过程中，承包人需要提交充分的证据来支持自己的主张。
可能的法律后果
- 如果法院或仲裁机构认定发包人存在违约行为，并判决或裁决发包人支付工程款和赔偿停工损失，那么发包人需要按照判决或裁决的结果履行义务。
- 如果发包人拒不履行判决或裁决，承包人可以申请强制执行，通过法律手段维护自己的合法权益。
注意事项
- 承包人在主张停工损失和工程款时，应注意时效问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，承包人应在知道或应当知道自己的权利受到侵害之日起三年内提起诉讼或申请仲裁。
- 承包人在主张停工损失时，应确保损失的计算合理且合法。如果损失计算过高或缺乏依据，可能会影响法院或仲裁机构的认定结果。
综上所述，停工损失跟工程款是可以一起主张的。如果你在建设工程合同中遇到了相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。