当结算时施工单位不确认，可以采取以下措施来应对和解决这一问题：
明确争议焦点与依据
- 梳理争议点：首先，需要仔细分析施工单位不确认的具体内容，这可能涉及工程量计算、单价确定、费用计取等多个方面。明确双方的分歧所在，是后续沟通和处理的基础。
- 核对合同条款：回顾施工合同中的相关条款，特别是关于结算方式、计价标准、变更调整等关键内容。确保结算过程严格遵循合同约定，为争议解决提供有力的依据。
积极沟通与协商
- 组织会议讨论：邀请施工单位代表、结算人员及相关专家召开会议，就争议问题进行深入讨论。通过面对面交流，增进理解，寻求共识，尝试达成双方都能接受的结算方案。
- 提供详细解释：针对施工单位的不确认之处，结算人员应提供详细的结算说明和计算依据。解释结算过程中的合理性和公正性，消除误解和疑虑。
- 考虑合理诉求：在坚持原则的基础上，充分考虑施工单位的合理诉求和实际情况。对于确实存在误差或不合理的地方，应及时进行调整和纠正，以体现公平和合理。
寻求第三方协助
- 申请调解：若双方无法达成一致意见，可申请行业协会、专业机构或政府相关部门进行调解。调解过程中，应保持客观公正的态度，积极配合调解工作，争取达成调解协议。
- 申请仲裁或诉讼：如调解无果，且合同中约定了仲裁条款或双方同意通过法律途径解决争议，则可向约定的仲裁委员会申请仲裁或直接向人民法院提起诉讼。在此过程中，需准备充分的证据材料，包括结算报告、合同文件、施工记录等，以支持自身主张。
后续管理与预防
- 总结经验教训：对本次争议解决过程进行全面总结，分析原因，找出问题所在。为今后的工程结算工作提供借鉴和改进方向，避免类似问题的再次发生。
- 完善管理制度：加强工程结算的规范化管理，建立健全结算制度和流程。提高结算人员的专业素养和业务能力，确保结算工作的准确性和公正性。
- 加强合同管理：在签订施工合同时，应明确结算方式、计价标准、变更调整等重要条款。减少因合同条款不清而产生的争议和纠纷，为工程结算提供明确的依据和保障。
在处理此类问题时，还需注意以下法律背景和建议：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。这为处理结算争议提供了法律基础。
- 建议：在处理结算争议时，应始终保持冷静和理性，遵循法律法规和合同约定。积极与施工单位沟通协商，寻求合理解决方案。如无法达成一致，及时寻求第三方协助或通过法律途径解决争议。同时，加强后续管理和预防工作，提高工程结算的准确性和公正性。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。