当遇到施工单位不办理结算的情况时，建设单位可以采取以下系统且操作性强的步骤来维护自身权益：

一、明确合同条款与法律依据

首先，建设单位应详细查阅与施工单位签订的《建设工程施工合同》，特别是关于结算期限、付款条件、违约责任以及争议解决方式的条款。这些条款是后续处理问题的法律依据，也是建设单位主张权益的基础。

二、书面催告与友好沟通

1. 发送书面催告函：

   • 建设单位应向施工单位发送正式的书面催告函，明确指出合同中约定的结算申报时间已过期，并要求施工单位在限定的合理期限内（如15个工作日内）提交完整的结算资料。
   • 催告函应通过可靠方式送达，如邮政特快专递（EMS），并在快递单上注明函件内容，保留好快递底单和物流签收记录，以备后续法律程序使用。

2. 友好沟通与协商：

   • 在发出催告函后，建设单位应积极与施工单位进行沟通，了解其不办理结算的具体原因。可能是施工单位内部流程问题、资金问题或是对工程量的争议等。
   • 尝试通过友好协商解决问题，可以组织双方参加的结算协商会议，形成会议纪要，记录协商过程和双方达成的共识。

三、全面收集证据

在整个处理过程中，建设单位应特别注意收集和保存与工程建设、结算相关的各类证据材料，包括但不限于：

• 合同文件及其附件
• 施工过程中的往来函件、电子邮件
• 工程变更通知、竣工验收报告
• 催告函、律师函及送达凭证
• 会议纪要、谈判记录等

这些证据将在后续可能的法律程序中发挥重要作用，有助于建设单位证明自己的主张。

四、采取法律手段

如果施工单位经催告和协商后仍不办理结算，建设单位可以依次采取以下法律手段：

1. 委托律师发律师函：

   • 建设单位可以委托专业律师向施工单位发送律师函，进一步阐述其不办理结算的违约性质以及可能面临的法律后果，督促其尽快履行结算申报义务。

2. 申请调解：

   • 可向建设工程所在地的建设行政主管部门、行业协会等申请第三方调解，利用专业机构的公正性和专业知识促进双方和解。

3. 提起诉讼或仲裁：

   • 若调解无效，根据合同中约定的争议解决方式，建设单位可以选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
   • 在诉讼或仲裁过程中，建设单位可以申请对工程造价进行司法鉴定，由专业的鉴定机构根据工程实际情况确定工程造价。

4. 行使优先受偿权：

   • 如施工单位逾期不支付工程款，建设单位（在特定情境下，如作为承包方时）有权依法行使优先受偿权，将工程折价或拍卖以优先清偿工程价款。但需注意行使此权利的期限和条件。

五、向相关部门投诉举报

除法律途径外，建设单位还可考虑向建设行政主管部门等政府机构投诉举报，请求其介入调查并协调解决结算纠纷。这有助于借助政府的力量推动问题的解决。

六、预防与改进

为避免类似问题再次发生，建设单位应在未来的合同中更加明确地约定结算流程、时间节点以及违约责任等关键条款。同时，加强合同管理，确保双方权益得到充分保障。在合同履行过程中，也应加强监督和沟通，及时发现并解决潜在风险和问题。

综上所述，当施工单位不办理结算时，建设单位应依据合同条款和法律规定，通过书面催告、沟通协商、法律手段等多种方式维护自身权益，并确保在处理过程中做好证据收集与保存工作。同时，也应注重合同的预防与改进，以避免类似问题的再次发生。