发包人与承包人签订的付款协议，在一般情况下，并不能直接阻碍施工人（通常指实际进行施工的单位或个人，可能是承包人下属的分包人或实际施工人）追款，但具体还需根据协议内容、施工人身份及法律关系等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、付款协议的性质与效力

1. 协议双方：发包人与承包人签订的付款协议，主要约束的是发包人和承包人双方。该协议通常规定了工程款的支付方式、时间、金额等条款，是双方之间关于工程款支付的约定。

2. 协议效力：只要该协议是双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议就是有效的，对发包人和承包人具有法律约束力。

二、施工人的追款权利

1. 施工人身份：施工人可能是承包人本身，也可能是承包人下属的分包人或实际施工人。如果施工人是承包人，那么其追款权利直接受付款协议的约束，但协议本身并不阻碍其依据协议追款。如果施工人是分包人或实际施工人，其追款权利则可能受到与承包人之间的合同关系以及法律规定的保护。

2. 追款依据：

   • 合同关系：施工人（尤其是分包人或实际施工人）与承包人之间通常存在合同关系，如分包合同或劳务合同等。根据这些合同，施工人有权要求承包人支付相应的工程款或劳务费。
   • 法律规定：在特定情况下，如承包人拖欠分包人或实际施工人工程款，且发包人欠付承包人工程款时，施工人可以依据相关法律规定（如《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》中的相关规定）直接向发包人主张权利，即突破合同相对性原则。

三、付款协议对施工人追款的影响

1. 协议内容：如果付款协议中明确约定了工程款的支付方式、时间等，且这些约定并不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议对发包人和承包人具有法律约束力。但这并不意味着施工人无法追款，因为施工人的追款权利可能来源于其与承包人之间的合同关系或法律规定。

2. 特殊情况：

   • 协议无效或可撤销：如果付款协议存在无效或可撤销的情形（如因欺诈、胁迫等签订），那么该协议对双方不具有法律约束力。此时，施工人追款可能不受该协议的限制。
   • 发包人直接支付：在某些情况下，发包人可能直接与施工人达成协议，同意直接向施工人支付工程款。这种情况下，付款协议对施工人追款的影响将取决于新协议的约定。

四、法律建议

1. 审查协议内容：施工人在追款前，应仔细审查付款协议的内容，了解协议对发包人和承包人的约束力以及可能对自己追款产生的影响。

2. 收集证据：施工人应收集与追款相关的证据，如合同、发票、付款记录等，以证明自己的权益。

3. 咨询专业律师：如果施工人对付款协议或追款问题存在疑问，建议咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

总结来说，发包人与承包人签订的付款协议并不能直接阻碍施工人追款，但具体还需根据协议内容、施工人身份及法律关系等多方面因素综合判断。施工人在追款过程中应仔细审查协议内容、收集证据，并在必要时咨询专业律师。