在行政诉讼中，若被告主体不适格，法院未裁定告知变更而是直接判决告知，这一做法通常是不合法的。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律依据与程序要求
根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释的规定，在行政诉讼中，如果原告所起诉的被告不适格，人民法院应当告知原告变更被告；原告不同意变更的，裁定驳回起诉。这一规定明确了法院在处理被告主体不适格问题时的程序要求，即应当先告知原告变更被告，而非直接作出判决。
二、法院判决的合法性分析
程序违法性：
- 法院在未告知原告变更被告的情况下直接作出判决，违反了法定程序。程序正义是司法公正的重要组成部分，法院必须严格遵守法定程序，确保当事人的诉讼权利得到充分保障。
实体处理不当：
- 即使法院在判决中认为被告行为合法，但由于被告主体不适格，这一判决在实体上也是站不住脚的。因为被告主体不适格意味着该被告并非本案的适格当事人，其行为是否合法与本案无关。
三、可能的法律后果
判决被撤销或改判：
- 如果原告对法院的判决不服并提起上诉，上级法院在审查后可能会认为原判决程序违法或实体处理不当，从而撤销原判决并改判或发回重审。
法院承担司法责任：
- 在极端情况下，如果法院的违法行为严重损害了当事人的合法权益，相关责任人员可能会承担司法责任，包括纪律处分、法律责任等。
四、建议与措施
对于原告：
- 如果原告发现法院在处理被告主体不适格问题时存在违法行为，可以及时向上级法院提起上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。
- 同时，原告在起诉时也应尽到合理的审查义务，确保所起诉的被告是适格的当事人。
对于法院：
- 法院在审理行政诉讼案件时，应严格遵守法定程序，确保当事人的诉讼权利得到充分保障。
- 在发现被告主体不适格时，应及时告知原告变更被告，避免程序违法和实体处理不当的问题发生。
总结来说，在行政诉讼中，若被告主体不适格，法院应当先告知原告变更被告，而非直接作出判决。如果法院未遵循这一程序要求，其判决可能因程序违法或实体处理不当而被撤销或改判。因此，建议当事人在遇到类似情况时及时寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。