结论前置：约定仲裁条款的代理合同如果违反国家强制性法规，一般情况下不能直接起诉至法院要求判决无效，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：
一、仲裁条款的效力与法院管辖
仲裁条款的独立性：根据《中华人民共和国仲裁法》第十九条，仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。这意味着，即使代理合同本身因违反国家强制性法规而无效，其中的仲裁条款仍然可能有效，除非该仲裁条款本身也违反了法律强制性规定。
法院管辖的排除：如果仲裁条款有效，根据《中华人民共和国仲裁法》第五条，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。因此，在仲裁条款有效的情况下，法院通常不会受理对合同纠纷的起诉。
二、仲裁条款无效的情形
违反法律强制性规定：如果仲裁条款本身违反了法律的强制性规定，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围，或者仲裁条款的形式、内容不符合法律要求，那么该仲裁条款可能被认定为无效。在此情况下，当事人可以向法院起诉，要求法院对合同纠纷进行审理。
例外情形：除了仲裁条款本身违反法律强制性规定外，还存在其他可能导致仲裁条款无效的情形，如当事人对仲裁协议的效力有异议，且一方请求仲裁委员会作出决定，另一方请求人民法院作出裁定的，由人民法院裁定；或者一方在首次开庭前未对仲裁协议的效力提出异议，而在后续诉讼中提出异议的，人民法院通常不予支持，但仲裁协议无效的除外。不过，这些情形并不直接涉及合同违反国家强制性法规的问题。
三、合同违反国家强制性法规的处理
合同无效的认定：如果代理合同本身违反了国家强制性法规，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，该合同可能被认定为无效。然而，合同无效并不直接导致仲裁条款无效，除非仲裁条款本身也违反了法律强制性规定。
后续处理：在合同被认定为无效的情况下，如果仲裁条款仍然有效，当事人应当通过仲裁解决纠纷。如果仲裁条款无效，或者当事人对仲裁条款的效力有异议且法院裁定仲裁条款无效，那么当事人可以向法院起诉要求解决合同纠纷。
法律建议：如果您认为代理合同中的仲裁条款违反了国家强制性法规，或者合同本身因违反国家强制性法规而无效，建议您首先仔细审查合同条款和仲裁条款，评估其合法性。如果认为仲裁条款可能无效，或者合同无效导致仲裁条款无法执行，您可以考虑向法院提起诉讼。但在此之前，建议您咨询专业律师，以便更准确地评估您的法律权益和可能的法律后果。
进一步思考：在处理此类纠纷时，除了考虑合同的合法性和仲裁条款的效力外，还需要考虑证据收集、诉讼策略、仲裁程序等多个方面。因此，建议您在采取任何法律行动之前，充分咨询并准备相关证据和材料。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。