您好，关于您提出的“已经离职如何认定劳动关系”的问题，这是一个涉及劳动法律关系的复杂但重要的问题。下面我将结合具体案例和法律规定，为您详细解答。

首先，要明确的是，劳动关系的认定并不完全依赖于是否签订了书面劳动合同，或者是否已经签署了离职报告。劳动关系的实质在于劳动者是否在用人单位的监督管理下提供有报酬的劳动，并且这种劳动是用人单位业务的组成部分。

一、劳动关系认定的核心要素

根据劳动和社会保障部《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发[2005]12号），认定劳动关系主要考虑以下三个核心要素：

1. 主体资格：用人单位和劳动者必须符合法律、法规规定的主体资格。
2. 劳动管理：用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动。
3. 业务组成：劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。

二、离职后继续工作的劳动关系认定

在您提到的情境中，如果劳动者已经签署了离职报告但仍在继续工作，劳动关系的认定需要综合考虑以下因素：

1. 实际工作情况：劳动者是否继续在原岗位工作，是否接受原用人单位的劳动管理，是否从事原用人单位安排的有报酬的劳动。
2. 工资支付情况：工资是否仍由原用人单位支付，或者虽然由其他公司代付，但代付行为是否基于原用人单位的指示或安排。
3. 证据保存：劳动者应注重保存考勤记录、工资发放凭证、工作证、岗位职责说明等证据，以证明其与原用人单位之间仍存在劳动关系。

三、具体案例分析

以您提供的案例为例，王某虽然与A公司签署了《解除劳动关系协议》，但后续仍在A公司工作，且工作地点、工作内容均未发生变更，工时时长也由A公司进行核算。尽管部分工资由其他公司转账支付，但根据A公司与第三方公司签订的服务协议以及工资报酬的核算方式，可以认定该支付行为为代付工资。因此，法院最终判决王某与A公司之间仍存在劳动关系。

四、建议

1. 对于劳动者：在离职后继续工作的情况下，应明确与用人单位的劳动关系状态，并注重保存相关证据以维护自身合法权益。如果用人单位试图通过复杂用工模式来规避法律责任，劳动者应及时向劳动人事争议仲裁委员会或法院寻求帮助。
2. 对于用人单位：应严格遵守劳动法律法规，禁止通过不订立劳动合同或用“合作协议”“劳务派遣协议”“临时用工”等名义掩盖真实劳动关系。同时，应建立健全的用工管理制度，确保劳动关系的清晰明确。

综上所述，已经离职但仍在继续工作的劳动关系的认定需要综合考虑多个因素，包括实际工作情况、工资支付情况以及证据保存等。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时告诉我。