结论：申请补交社保后公司解除劳动合同是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司解除劳动合同的理由不合法：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同必须基于法定理由，如劳动者严重违反公司规章制度、严重失职造成重大损害、被依法追究刑事责任等。若公司仅因劳动者申请补交社保而解除劳动合同，且该申请本身并不构成上述法定解除理由，则公司的解除行为属于违法解除。
   • 在此情况下，劳动者有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金，赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。

2. 若公司解除劳动合同的理由合法，但与申请补交社保无直接关联：

   • 如果公司解除劳动合同是基于劳动者存在其他严重违反公司规章制度或法律法规的行为，且这些行为与申请补交社保无直接关联，那么公司的解除行为可能是合法的。
   • 但即便如此，公司仍需确保解除劳动合同的程序合法，如提前通知劳动者、听取劳动者申辩、通知工会等，否则仍可能构成违法解除。

3. 若公司以申请补交社保为由，变相逼迫劳动者离职：

   • 如果公司通过调整工作岗位、降低工资、增加工作量等不正当手段，变相逼迫劳动者因无法忍受而主动离职，且这些手段与申请补交社保有直接关联，那么公司的行为可能构成违法解除或变相辞退。
   • 劳动者在此情况下，同样有权要求公司支付赔偿金或要求继续履行劳动合同。

建议：

• 劳动者在申请补交社保后，若公司提出解除劳动合同，应首先要求公司出具书面解除通知，并明确解除理由。
• 若认为公司的解除行为不合法，劳动者可以与公司协商，要求继续履行劳动合同或支付赔偿金；协商不成的，可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
• 在整个过程中，劳动者应保留好相关证据，如申请补交社保的凭证、公司解除劳动合同的通知、与公司的沟通记录等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的主张。