结论：针对您描述的情况，即两个用工单位同时为您申报了个税，且其中一个单位不再继续用工，而您的工资未超过5000元，是否需要处理，这主要取决于您是否希望继续在该单位保留劳动关系或存在其他特殊需求。一般情况下，若您与该单位已无实际劳动关系且无其他特殊需求，则无需特别处理；但若存在特殊情况，如需要开具离职证明、处理社保公积金等，则需与该单位沟通解决。以下从不同角度为您详细分析：
一、个税申报与劳动关系
个税申报与劳动关系的关联：
- 个税申报是用人单位根据税法规定，为其员工申报个人所得税的行为。它反映了用人单位与员工之间的劳动关系存在及工资薪金发放情况。
- 若一个单位不再继续用工，理论上应停止为您申报个税，并办理相关离职手续。
工资未超过5000元的影响：
- 工资未超过5000元，在个税方面可能享受免征额或较低的税率，但这并不影响劳动关系的存在与否。
- 无论工资多少，只要存在劳动关系，用人单位就应依法申报个税（若达到申报标准）并履行其他劳动法义务。
二、是否需要处理的情况分析
无需特别处理的情况：
- 若您与该单位已无实际劳动关系，且无需该单位开具离职证明、处理社保公积金等后续事宜，那么您无需对该单位的个税申报进行特别处理。
- 您可以关注自己的个税申报情况，确保两个单位没有重复申报或错误申报导致您需要补缴税款或面临其他税务风险。但这种情况下的关注更多是基于个人税务合规的考虑，而非针对该单位的特别处理。
需要处理的情况：
- 离职证明与社保公积金：若您需要该单位开具离职证明或处理社保公积金等后续事宜，那么您需要与该单位沟通，要求其办理相关手续并停止为您申报个税。
- 税务风险防控：若您发现该单位仍在为您申报个税，而您已不在该单位工作，这可能导致您面临税务风险（如被税务机关认为存在隐瞒收入等行为）。此时，您应及时与该单位沟通，要求其更正申报信息，并保留好相关证据（如离职证明、工资发放记录等）以备不时之需。
三、建议与措施
与用人单位沟通：
- 若您与该单位仍有联系或能够联系到该单位的相关负责人，建议您主动与其沟通，明确告知您已不在该单位工作，并要求其停止为您申报个税并办理相关离职手续。
关注个税申报情况：
- 您可以定期登录个人所得税APP或网站，查看自己的个税申报情况，确保没有重复申报或错误申报的情况发生。
保留证据：
- 无论您是否需要与该单位沟通或处理相关事宜，都建议您保留好与该单位的劳动关系证明（如劳动合同、工资发放记录、离职证明等），以备不时之需。
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