结论：人事部所说的“请假一个星期以上自动离职”的规定，是否包含生病住院的情况，需依据公司规章制度的具体内容、制定程序以及是否与法律法规相冲突来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度的内容与解释
规章制度的具体内容：
- 如果公司规章制度中明确规定了“请假一个星期以上（无论何种原因）均视为自动离职”，那么从字面意思上看，生病住院请假超过一个星期也可能被视为自动离职。但这样的规定可能过于严苛，且缺乏人性化考量。
- 如果规章制度中区分了请假原因，如“因非医疗原因请假一个星期以上视为自动离职”，则生病住院请假可能不受此限制。
规章制度的解释权：
- 规章制度的解释权通常归公司所有，但解释必须合理且符合法律法规。如果公司对规章制度的解释存在歧义或不合理之处，员工有权提出异议。
二、公司规章制度的制定程序与合法性
制定程序：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 如果公司规章制度未经上述程序制定或修改，可能因程序违法而无效。
合法性审查：
- 规章制度的内容必须符合法律法规的规定，不得侵犯劳动者的合法权益。例如，规章制度中不得规定“请假即视为自动离职”等明显违反劳动法律法规的条款。
- 如果规章制度中的规定与法律法规相冲突，则该规定无效，公司不能依据该规定对员工进行处理。
三、生病住院请假的特殊情况
医疗期的保护：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 在医疗期内，公司不得依据规章制度中的“请假一个星期以上自动离职”等规定对员工进行处理。
请假手续与证明：
- 员工因生病住院请假时，应按照公司规定办理请假手续，并提供相应的医疗证明。公司应核实员工的请假原因和医疗证明的真实性，并据此作出合理处理。
四、建议与行动
查阅公司规章制度：
- 建议您首先查阅公司的规章制度，了解其中关于请假和自动离职的具体规定。
与公司沟通：
- 如果您对规章制度中的规定存在疑问或异议，可以与公司人事部门或相关负责人进行沟通，寻求合理的解释和解决方案。
寻求法律援助：
- 如果公司依据规章制度中的不合理规定对您进行处理，且您认为该规定违反了法律法规或侵犯了您的合法权益，您可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总之，人事部所说的“请假一个星期以上自动离职”的规定是否包含生病住院的情况，需结合公司规章制度的具体内容、制定程序以及是否与法律法规相冲突来综合判断。如果您对此存在疑问或异议，建议及时与公司沟通并寻求法律援助。如有其他劳动纠纷或工伤赔偿方面的问题，也可以直接向我咨询。