结论：事业单位人员挂证取酬，在纪委查出之前已经注销且金额不大的情况下，仍可能面临纪律处分，但具体处理方式会因地区、单位及具体情节而有所不同。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律与纪律规定
事业单位人员行为规范：
- 事业单位人员应当遵守职业道德和行业规范，不得利用职务之便谋取私利。挂证取酬，即利用自己的专业资格证书挂靠在其他单位以获取报酬，这种行为往往违反了事业单位人员的职业道德和行业规范。
纪律处分规定：
- 根据《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关法规，事业单位工作人员有违法违纪行为的，应当给予处分。处分种类包括警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除等。挂证取酬行为，即使金额不大，也可能被视为违法违纪行为，从而受到相应的纪律处分。
二、具体情节的影响
注销时间点：
- 虽然您在纪委查出之前已经注销了挂证，但这一行为本身已经发生，且可能已经构成了违法违纪的事实。注销行为可能作为从轻或减轻处分的情节考虑，但并不能完全免除责任。
金额大小：
- 金额不大可能作为从轻或减轻处分的情节之一。然而，具体是否从轻或减轻，以及减轻的程度，还需根据当地纪委或主管部门的裁量权来决定。
三、可能的处理方式
纪律处分：
- 根据具体情节，您可能面临警告、记过等较轻的处分，也可能面临更严重的处分，如降低岗位等级、撤职或开除。这取决于您所在单位、当地纪委或主管部门的裁量权以及您行为的具体情节。
退缴违法所得：
- 除了纪律处分外，您还可能需要退缴通过挂证取酬所获得的全部或部分报酬。这是纪律处分的一种常见附加措施，旨在恢复公平和正义。
教育整改：
- 在某些情况下，纪委或主管部门可能还会要求您进行教育整改，以纠正您的错误观念和行为。这可能包括参加培训、撰写检讨书等。
四、建议与措施
主动配合调查：
- 如果纪委或主管部门已经介入调查，建议您主动配合调查工作，如实说明情况，提供相关证据和资料。这有助于减轻您的责任，并展示您的诚意和态度。
积极整改：
- 无论最终处理结果如何，您都应该积极整改自己的行为，遵守职业道德和行业规范，不再从事类似违法违纪行为。这有助于您恢复声誉和信誉，并避免未来可能面临的法律风险。
咨询专业意见：
- 如果您对处理结果有异议或需要进一步的法律帮助，可以向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。
总结：事业单位挂证取酬行为即使金额不大且在纪委查出前已注销，仍可能面临纪律处分。具体处理方式将取决于多种因素，包括当地纪委或主管部门的裁量权、您行为的具体情节以及您的态度等。因此，建议您主动配合调查、积极整改，并在必要时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。