签订50年农村房子托管协议，其效力需分情况讨论：

1. 若协议内容符合法律规定，且不存在其他无效情形，则协议有效，但超出法定租赁期限的部分无效。根据《中华人民共和国民法典》第七百零五条的规定，租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。农村房子托管协议，若其本质属于租赁合同关系（即托管方支付租金，获得房屋的使用权和管理权），则其期限应受此限制。因此，若协议约定的托管期限为50年，那么超出20年的部分将被视为无效。不过，这并不意味着整个协议无效，只是超出法定租赁期限的部分无效，协议的其他部分（如租金支付方式、托管方的权利和义务等）仍然有效。

2. 若协议并非单纯的租赁合同，而是包含了其他复杂的法律关系，如委托管理、合作经营等，则需根据具体条款和实际情况判断其效力。在这种情况下，协议的效力不仅取决于托管期限，还取决于协议的具体内容、双方当事人的意思表示是否真实、是否违反法律、行政法规的强制性规定等因素。如果协议内容合法、双方意思表示真实，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么即使托管期限较长，协议也可能是有效的。但同样需要注意的是，如果协议中包含了租赁关系，那么租赁部分的期限仍然不得超过二十年。

建议：在签订农村房子托管协议时，双方应明确协议的性质和目的，合理约定托管期限，并确保协议内容合法、合规。如果托管期限较长，可以考虑在协议中设置续期条款或分期签订协议等方式来规避法律风险。同时，在签订协议前，建议咨询专业律师或法律机构，以确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。