结论前置：新员工入职5天后自离，在大多数情况下是有权获得这5天工资的，但具体是否支付及支付金额需根据双方约定、实际情况及法律规定综合判断。
详细分析：
基本法律原则：
- 根据我国《劳动法》及相关劳动法规，劳动者为用人单位提供了劳动，无论其工作时间长短，用人单位都应当按照约定支付相应的劳动报酬。这是保障劳动者合法权益的基本原则，也是用人单位应尽的基本义务。
工资计算与支付：
- 工资的计算应基于劳动者实际工作的天数和双方事先约定的工资标准。例如，若新员工的月工资约定为5000元，且一个月按21.75个工作日计算，那么其日工资约为229.89元。若该新员工工作了5天，则其应得工资为1149.45元（\(229.89元/天 \times 5天\)）。
- 用人单位不得因劳动者工作时间短或自离而克扣或拒付工资。这是法律对劳动者权益的明确保护。
特殊情况处理：
- 协议约定：如果新员工在入职时与用人单位签订了相关协议，如规定必须工作满一定时间才能获得工资，或因个人原因突然离职需扣除部分工资等，那么应按照协议来处理。但此类协议必须合法合规，不得违反法律法规的强制性规定，否则将被视为无效。
- 交接工作完成情况：新员工离职时，如果未按照法律规定提前通知用人单位且未完成交接工作，给用人单位造成损失的，用人单位可以依法要求新员工赔偿损失，并可从其工资中予以合理扣除。但扣除的金额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。如果新员工已完成交接工作且未造成损失，用人单位则应支付全额工资。
维权途径：
- 若用人单位拒绝支付或拖延支付工资，新员工首先应与用人单位进行友好协商，尝试通过沟通解决问题。
- 协商不成时，新员工可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位支付工资。
- 新员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。在仲裁过程中，新员工需要提供相关证据来证明自己的主张。
总结与建议：
新员工入职5天后自离是否有工资，主要取决于双方的约定、实际工作情况以及法律规定。在大多数情况下，劳动者有权获得实际工作天数的工资。然而，如果存在特殊协议或未完成交接工作等情况，可能会影响工资的支付。因此，建议新员工在离职前尽量与用人单位协商好工资支付事宜，并完成必要的交接工作。如果遇到用人单位拒绝支付或拖延支付工资的情况，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。