员工因违纪被解除劳动合同的合法流程主要包括以下几个步骤：

1. 规章制度制定与公示：

   • 制定合法有效的规章制度：用人单位应依据《劳动合同法》第四条的规定，制定包含员工违纪处理条款的规章制度。这些条款应明确违纪行为的种类、后果及处理程序，确保内容合法、合理且具体。
   • 规章制度公示或告知员工：规章制度制定后，需通过民主程序（如职工代表大会或全体职工讨论）进行公示，或直接告知员工（如通过培训、签字确认等方式），确保员工知晓并理解规章制度的内容。

2. 收集违纪证据：

   • 证据收集：用人单位在发现员工存在违纪行为时，应及时收集相关证据，如监控录像、书面记录、证人证言等，以证明员工确实存在违纪事实。
   • 证据保存：所有证据应妥善保存，以备后续可能的劳动仲裁或诉讼使用。

3. 通知工会（如有）：

   • 通知义务：根据《劳动合同法》第四十三条的规定，用人单位单方解除劳动合同，应当事先将理由通知工会。工会认为用人单位解除行为不适当的，有权提出意见。
   • 处理工会意见：用人单位应研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。若工会提出异议，用人单位应慎重考虑并作出合理回应。

4. 作出解除决定并通知员工：

   • 解除决定：在确认员工存在严重违纪行为且符合规章制度规定的解除条件时，用人单位可以作出解除劳动合同的决定。
   • 通知员工：解除决定应以书面形式通知员工，并明确解除的理由、依据及生效时间。通知应送达员工本人，并保留送达证据。

5. 办理离职手续：

   • 工作交接：员工应按照用人单位的要求办理工作交接手续，确保工作的连续性和稳定性。
   • 薪资结算：用人单位应按照劳动合同和规章制度的规定，结算员工的工资、奖金、经济补偿等费用。
   • 出具离职证明：根据《劳动合同法》第五十条的规定，用人单位应在解除或终止劳动合同时出具离职证明，并在十五日内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。

法律建议与风险提示：

• 确保规章制度合法有效：用人单位应确保规章制度的制定程序合法、内容合法且已公示或告知员工，否则可能面临规章制度无效的风险。
• 谨慎收集与保存证据：证据是解除劳动合同的关键，用人单位应确保收集的证据真实、合法且充分，以证明员工的违纪行为。
• 遵循法定程序：用人单位在解除劳动合同时，应严格遵循法定程序，如通知工会、书面通知员工等，否则可能构成违法解除，需承担相应的法律责任。
• 考虑经济补偿与赔偿：若员工因违纪被解除劳动合同且符合规章制度规定的条件，用人单位通常无需支付经济补偿。但若用人单位违法解除劳动合同，则需支付赔偿金。

后续行动建议：

• 若您作为用人单位，在解除员工劳动合同时遇到任何疑问或困难，建议及时咨询专业律师，以确保解除行为的合法性和有效性。
• 若您作为员工，认为用人单位的解除行为违法或不合理，您有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

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