针对领导违规指使手下违法犯罪并破格提拔的情况，可依法从以下角度处理：
对领导行为的法律定性及追责
领导指使他人实施违法犯罪行为，可能构成共同犯罪中的主犯或教唆犯。根据《刑法》第二十五条至第二十九条，若手下人实施的是犯罪行为（如贪污、诈骗、环境污染等），领导可能因共同犯罪被追究刑事责任，具体罪名取决于犯罪类型（如贪污罪、诈骗罪、污染环境罪等）。若手下人实施的是违法行为（未达刑事立案标准），领导可能面临行政处罚（如罚款、拘留）或党纪处分（如警告、撤职）。
关键证据：需收集领导指使的直接证据（如书面指令、录音、聊天记录、证人证言等），以及手下人实施违法犯罪行为的证据（如财务记录、现场照片、鉴定报告等）。
对破格提拔行为的法律救济
若提拔程序违反《公务员法》《党政领导干部选拔任用工作条例》等规定（如未公示、未考察、未民主测评等），可向组织部门、纪检监察机关举报，要求撤销提拔决定并重新审查。若提拔基于领导滥用职权（如伪造业绩、操纵考核），可能构成《刑法》第三百九十七条的滥用职权罪，可同步向检察机关举报。
操作路径：通过单位内部举报渠道（如纪委、监察室）或向上级机关（如上级党委、政府）实名举报，附上证据材料（如提拔文件、考核记录、证人联系方式等）。
对手下人的法律保护与责任划分
手下人若被胁迫参与违法犯罪，可依据《刑法》第二十八条主张“被胁迫参加犯罪”，争取从轻或减轻处罚。若手下人主动参与且未被胁迫，则需承担相应刑事或行政责任，但可举报领导指使行为以争取立功表现。
建议行动：手下人应立即停止违法行为，保留被指使的证据（如领导指令记录），主动向公安机关或纪检监察机关自首并举报领导，以降低自身法律风险。
单位内部治理与制度完善建议
单位应建立“违法犯罪行为零容忍”机制，明确禁止任何形式的指使违法指令，并设立匿名举报渠道。对提拔程序引入第三方监督（如审计部门、群众代表），防止权力滥用。同时，定期开展法治培训，强化员工法律意识。
总结：此类案件需“刑事追责+行政纠正+内部治理”多管齐下。建议优先收集证据，同步向公安机关（刑事案件）、纪检监察机关（违纪案件）、组织部门（提拔程序）举报，并推动单位完善制度。具体操作中需注意证据合法性（如录音需符合取证规范）、举报时效（刑事案件追诉期、行政处罚时效）等问题，可进一步向我咨询细节。