针对您提出的“领导指使下属犯罪怎么办”这一问题，这是一个涉及法律责任和管理责任的复杂情况，我将从法律责任、应对措施以及后续改进三个方面为您详细解答。
一、法律责任
刑事责任：
- 如果领导确实指使下属犯罪，那么领导与下属将构成共同犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，共同犯罪是指二人以上共同故意犯罪。领导作为指使者，可能被视为共同犯罪中的主犯，需承担较重的刑事责任，包括有期徒刑、罚金等。
- 即便领导没有直接参与犯罪行为，但如果因严重不负责任，不履行或不正确履行管理职责，导致下属犯罪并造成严重后果，领导也可能构成玩忽职守罪、滥用职权罪等渎职类犯罪。
行政责任：
- 除了刑事责任外，领导还可能面临行政责任。单位或上级主管部门可能根据内部规章制度，对领导进行警告、记过、降级、撤职等纪律处分。
- 如果领导的行为违反了行政管理法规，行政机关还可能对其作出罚款、吊销许可证等行政处罚。
民事责任：
- 若下属的犯罪行为给他人造成了经济损失，且领导在管理上存在过错，领导可能与下属一起承担连带赔偿责任。
二、应对措施
立即停止犯罪行为：
- 如果领导已经意识到自己指使下属犯罪的行为是违法的，应立即停止这种行为，并防止犯罪行为的进一步扩大。
积极配合调查：
- 一旦得知下属涉嫌犯罪或自己被调查，领导应立即配合相关部门的调查工作，提供必要的证据和信息，以查清事实真相。
采取内部措施：
- 对涉嫌犯罪的下属进行停职处理，防止其继续利用职权或影响组织运营。
- 加强内部管理，完善制度规范，堵塞漏洞，防止类似事件再次发生。例如，可以加强员工培训，提高员工的法律意识和合规意识。
处理与受害者的关系：
- 如果下属的犯罪行为给受害者造成了损失或伤害，领导应代表组织与受害者协商，尽力弥补损失并表达歉意，以维护组织的形象和社会责任感。
三、后续改进
反思管理方式：
- 领导应认真反思自己的管理方式，查找存在的问题和不足。例如，是否过于强调业绩而忽视了合规性，是否对下属的监管不够严格等。
完善内部控制体系：
- 建立和完善内部控制体系，包括制定明确的规章制度、加强内部审计和监督、建立举报机制等，以提高组织的合规水平和风险防范能力。
加强法律合规培训：
- 定期组织员工进行法律合规培训，提高员工的法律意识和合规意识，确保员工了解并遵守相关法律法规和内部规章制度。
总之，领导指使下属犯罪是一种严重的违法行为，不仅会对下属造成极大的伤害，也会对领导自身和组织带来严重的法律后果。因此，领导应严格遵守法律法规，加强自我约束和管理，确保下属不违法乱纪，维护组织和社会的良好秩序。如果已经发生了此类事件，领导应积极配合调查，采取必要的内部措施，并反思和改进自己的管理方式。