工厂因车辆超速被罚款1000元，可按以下步骤处理：

1. 确认处罚主体与依据
   首先需明确处罚主体是交警部门（针对厂内道路连接公共道路的情况）还是工厂内部安全管理部门（针对完全封闭的厂内道路）。
   

• 交警处罚：依据《道路交通安全法》第90条，机动车超速行驶可处20-200元罚款；若情节严重（如超速50%以上），可能面临更高处罚。此时需核对处罚决定书中的违法事实、法律依据及罚款金额是否合法。
  
• 工厂内部处罚：若工厂依据内部安全管理制度处罚，需检查制度是否经民主程序制定（如职工代表大会通过）、是否公示，且罚款金额不得超过员工月工资的20%（依据《劳动合同法》第4条、第80条）。若制度违法，可主张撤销处罚。

1. 核实超速事实与证据
   

• 交警处罚：要求查看测速设备合格证明、测速记录（如雷达测速仪数据、监控录像），确认是否存在设备误差或程序违法（如未设置警示标志）。
  
• 工厂处罚：检查工厂是否提供有效证据（如测速仪记录、目击证人证言），若证据不足或程序违规（如未提前告知员工限速标准），可拒绝接受处罚。

1. 选择处理方式
   

• 接受处罚：若事实清楚、程序合法，建议按时缴纳罚款（交警处罚需在15日内到指定银行缴纳，逾期可能产生滞纳金；工厂处罚需按制度执行）。
  
• 申请复议或诉讼：
  
  • 交警处罚：可在收到处罚决定书60日内向上一级交警部门申请行政复议，或6个月内直接向法院提起行政诉讼。
    
  • 工厂处罚：若认为处罚违法，可向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁（需在1年内提出）。
    
• 协商解决：与工厂协商调整处罚金额或方式（如以培训代替罚款），但需确保协商结果不违反法律强制性规定。

1. 预防后续风险
   

• 工厂管理建议：若为工厂内部处罚，建议完善安全管理制度，明确限速标准、测速设备使用规范及处罚程序，并组织员工培训。
  
• 个人行为建议：驾驶车辆时严格遵守限速规定，避免因超速引发安全事故或法律责任。

提示：若对处罚有疑问，可直接向我咨询具体细节（如处罚决定书内容、工厂制度条款等），我会进一步分析合法性并提供应对方案。