在劳动仲裁过程中，如果发现书记员存在违法违规行为，这确实是一个需要严肃对待的问题，因为它可能影响到仲裁的公正性和合法性。以下是一些详细的处理步骤和建议，希望能帮助您有效应对这种情况：

一、立即提出异议

重要性：及时提出异议是确保仲裁程序合法性的首要步骤。一旦您发现书记员存在如应当回避而未回避、未按规定记录或送达相关文书等违法违规情形，应立即向仲裁庭提出异议。

提出方式：您可以通过口头或书面形式向仲裁庭表达您的异议，并明确指出书记员的具体违法违规行为及其对您权益的影响。

处理方式与结果：仲裁机构在收到您的异议后，会迅速对相关程序问题进行审查。如果确认存在违法违规问题，仲裁机构将采取相应措施进行纠正，如更换书记员、重新记录或送达文书等，以确保仲裁程序的合法性和公正性。

二、申请撤销劳动仲裁裁决（如已作出裁决）

法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十九条，如果用人单位有证据证明仲裁裁决存在违反法定程序等可撤销情形，可以自收到仲裁裁决书之日起三十日内向劳动争议仲裁委员会所在地的中级人民法院申请撤销裁决。虽然这一条款主要针对用人单位，但劳动者在特定情况下（如发现裁决程序严重违法且影响公正性时）也可考虑此途径，或咨询律师了解具体权益。

申请流程：

1. 收集证据：您需要搜集能证明书记员违法违规行为的证据，如仲裁记录、送达回证、证人证言等。
2. 提出申请：在法定时限内向中级人民法院提交撤销仲裁裁决的申请及相关证据材料。
3. 法院审查与裁定：法院将组成合议庭对申请进行审查。如果确认仲裁裁决存在违反法定程序等情形，且这些情形足以影响裁决的公正性，法院将裁定撤销该仲裁裁决。

三、向人民法院提起诉讼（如对裁决不服）

法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十八条，劳动者对仲裁裁决不服的，可以自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。

诉讼流程：

1. 准备诉状：您需要准备一份详细的诉状，阐述您对仲裁裁决的不满以及书记员违法违规行为对您权益的影响。
2. 提交法院：将诉状及相关证据材料提交给有管辖权的人民法院。
3. 法院审理与判决：法院将对整个劳动争议案件进行全面审查，包括程序和实体问题，并依法作出判决。

四、重新申请劳动仲裁（如裁决被撤销）

如果因书记员违法违规行为导致仲裁裁决被撤销，您可以依据相关法律规定和仲裁规则，重新申请劳动仲裁。在重新申请时，请确保所有程序都符合法律规定，并密切关注仲裁过程的合法性。

总结与建议

在处理劳动仲裁过程中书记员违法违规问题时，我建议您：

1. 密切关注仲裁程序：时刻留意仲裁过程的合法性，一旦发现违法违规行为，立即提出异议。
2. 及时咨询专业律师：律师能为您提供更为准确和具体的法律指导，帮助您更好地维护自己的权益。
3. 保留相关证据：在仲裁过程中，请务必保留好所有与案件相关的证据材料，以备不时之需。

通过综合运用上述法律知识和建议，您应该能够有效地应对劳动仲裁过程中书记员的违法违规行为，维护自己的合法权益。