对于严重程序违法的仲裁员，应当依法依规予以处理，具体处理方式需根据违法情形及后果的严重程度来确定，以下分情况说明：

1. 内部纪律处分：

   • 若仲裁员在仲裁程序中存在轻微的程序违规行为，但尚未造成严重后果，仲裁机构通常会依据其内部纪律规定，对仲裁员进行警告、记过、降级等纪律处分。这些处分旨在警示仲裁员，促使其纠正错误，维护仲裁程序的公正性和严肃性。

2. 撤销仲裁员资格：

   • 若仲裁员的程序违法行为较为严重，如故意违反法定程序、徇私舞弊、枉法裁决等，且这些行为已经或可能对仲裁结果产生重大影响，仲裁机构或相关监督机构有权撤销其仲裁员资格。撤销资格是对仲裁员严重失职行为的严厉制裁，旨在维护仲裁制度的公信力和权威性。

3. 承担法律责任：

   • 若仲裁员的程序违法行为构成犯罪，如受贿、滥用职权等，将依法追究其刑事责任。此外，若仲裁员的违法行为给当事人造成损失，当事人还有权依法要求仲裁员承担民事赔偿责任。这些法律责任旨在惩罚违法行为，保护当事人的合法权益。

4. 仲裁裁决的撤销或不予执行：

   • 根据《仲裁法》的相关规定，若仲裁程序违反法定程序，当事人可以向人民法院申请撤销仲裁裁决或不予执行。这是对当事人权益的重要保障，也是对仲裁员程序违法行为的间接制裁。当仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人可以重新选择仲裁或诉讼等方式解决争议。

在实际操作中，对于仲裁员程序违法的处理需严格遵循法定程序和证据规则。仲裁机构或相关监督机构在调查处理时，应确保事实清楚、证据确凿、程序合法，以维护仲裁制度的公正性和权威性。同时，当事人也应积极行使自己的权利，及时提出异议并寻求法律救济。

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